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1. (WO2010017559) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES POUR PRÉVOIR DES PROTÉINES QUI PEUVENT ÊTRE SÉCRÉTÉES DANS DES LIQUIDES ORGANIQUES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2010/017559    N° de la demande internationale :    PCT/US2009/053309
Date de publication : 11.02.2010 Date de dépôt international : 10.08.2009
CIB :
G01N 33/00 (2006.01)
Déposants : UNIVERSITY OF GEORGIA RESEARCH FOUNDATION, INC. [US/US]; 629 Boyd Graduate Studies Research Center Technology Commercialization Office Athens, GA 30602-7411 (US) (Tous Sauf US).
CUI, Juan [CN/US]; (US) (US Seulement).
PUETT, David [US/US]; (US) (US Seulement).
XU, Ying [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : CUI, Juan; (US).
PUETT, David; (US).
XU, Ying; (US)
Mandataire : MCCABE, Kevin, W.; (US)
Données relatives à la priorité :
61/136,043 08.08.2008 US
Titre (EN) METHODS AND SYSTEMS FOR PREDICTING PROTEINS THAT CAN BE SECRETED INTO BODILY FLUIDS
(FR) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES POUR PRÉVOIR DES PROTÉINES QUI PEUVENT ÊTRE SÉCRÉTÉES DANS DES LIQUIDES ORGANIQUES
Abrégé : front page image
(EN)The present invention is directed to methods and systems for predicting protein secretion into bodily fluids. In an embodiment, a method uses a feature set comprising secretory properties of collected proteins to train a classifier, based on the feature set, to recognize protein features corresponding to proteins that are likely to be secreted into a biological fluid. Another method determines, using a trained classifier and identified features of a received protein sequence, the probability of the protein sequence being secreted into a biological fluid. In an embodiment, a system predicts the secretion of proteins into a biological fluid. The system comprises components configured to construct a protein feature set comprising properties of collected proteins, train a classifier to predict features of a protein that is likely to be secreted into the biological fluid, receive a protein sequence, and identify the received protein sequence as a secretory protein.
(FR)La présente invention concerne des procédés et des systèmes pour prévoir une sécrétion de protéine dans des liquides organiques. Dans un mode de réalisation, un procédé utilise un ensemble de caractéristiques qui comporte des propriétés de sécrétion de protéines recueillies pour former un dispositif de classement, sur la base de l'ensemble de caractéristiques, à reconnaître des caractéristiques de protéine correspondant à des protéines qui sont susceptibles d'être sécrétées dans un liquide biologique. Un autre procédé détermine, à l’aide d’un dispositif de classement formé et des caractéristiques identifiées d'une séquence de protéine reçue, la probabilité que la séquence de protéine est sécrétée dans un liquide biologique. Dans un mode de réalisation, un système prévoit la sécrétion de protéines dans un liquide biologique. Le système comprend des composants configurés pour construire un ensemble de caractéristiques de protéines qui comprend des propriétés des protéines recueillies, la formation d'un dispositif de classement pour prévoir des caractéristiques d'une protéine qui est susceptible d'être sécrétée dans le liquide biologique, la réception d'une séquence de protéine et l'identification de la séquence de protéine reçue en tant que protéine sécrétrice.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, SE, SI, SK, SM, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)