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1. (WO2008126151) PROCÉDÉ ET DISPOSITIF D'ANALYSE DE DONNÉES DE SPECTROMÉTRIE DE MASSE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2008/126151    N° de la demande internationale :    PCT/JP2007/000366
Date de publication : 23.10.2008 Date de dépôt international : 04.04.2007
CIB :
G01N 27/62 (2006.01)
Déposants : Shimadzu Corporation [JP/JP]; 1, Nishinokyo-Kuwabara-cho, Nakagyo-ku, Kyoto-shi Kyoto 6048511 (JP) (Tous Sauf US).
KAJIHARA, Shigeki [JP/JP]; (JP) (US Seulement)
Inventeurs : KAJIHARA, Shigeki; (JP)
Mandataire : KOBAYASI, Ryohei; KOBAYASI PATENT & TRADEMARK, 7th Floor, Hougen-Sizyokarasuma Building, 37, Motoakuozi-tyo, Higasinotouin Sizyo-sagaru, Simogyo-ku, Kyoto-si, Kyoto 6008091 (JP)
Données relatives à la priorité :
Titre (EN) MASS SPECTROMETRY DATA ANALYZING METHOD AND DEVICE
(FR) PROCÉDÉ ET DISPOSITIF D'ANALYSE DE DONNÉES DE SPECTROMÉTRIE DE MASSE
(JA) 質量分析データ解析方法及び装置
Abrégé : front page image
(EN)A protein is identified by analyzing mass spectrum data collected from micro regions (pixels) defined by dividing a two-dimensional region on a sample by a method including the following steps. A mass window including the peak appearing in the mass spectrum of each pixel is defined (S10), the integrated value of the ion intensities of the peaks within each mass window is calculated (S11), a mapping image is created by aggregating the intensity integrated value of the pixels for each mass window (S12), the mass windows are classified into groups by judging the similarity of the mapping image (S13, S14), a mass spectrum is created by aggregating the peaks on the assumption that the peaks within the mass windows in the same group are originated from the same substance (S15), and a protein is identified by PMF or the like on the basis of the mass spectrum (S16, S17). With this, even if a plurality of proteins are present, the identification accuracy is enhanced.
(FR)L'invention concerne l'identification d'une protéine par l'analyse des données d'un spectre de masse de micro-régions (pixels) définies en divisant une région bidimensionnelle d'un échantillon, par un procédé comportant les étapes suivantes. Une fenêtre de spectrométrie comprenant le pic apparaissant sur le spectre de masse de chaque pixel est définie (S10), la valeur cumulée des intensités ioniques des pics dans chaque fenêtre de spectrométrie est calculée (S11), une image cartographique est générée en agrégeant les valeurs cumulées des intensités des pixels pour chaque fenêtre de spectrométrie (S12), les fenêtres de spectrométrie sont classées en groupes en fonction de leur similitude avec l'image cartographique (S13, S14), un spectre de masse est généré en agrégeant les pics et ce, en supposant que les pics dans les fenêtres de spectrométrie du même groupe proviennent de la même substance (S15) et une protéine est identifiée par PMF ou équivalent sur la base du spectre de masse (S16, S17). Ainsi, même en présence d'une pluralité de protéines, la précision de l'identification est renforcée.
(JA) 試料上の二次元領域を細かく区分した各微小領域(ピクセル)に対して得られる質量スペクトルデータを解析処理しタンパク質を同定するに際し、まず各ピクセルの質量スペクトルに現れるピークを含むように質量ウインドウを設定し(S10)、各質量ウインドウ内に入るピークのイオン強度の積算値を計算する(S11)。そして、質量ウインドウ毎に各ピクセルの強度積算値を集めてマッピング画像を作成し(S12)、マッピング画像の類似性を判断して質量ウインドウをグループ分けする(S13、S14)。同一グループに入る質量ウインドウ内のピークは同一種類の物質に由来するとみなし、それらピークを集めて質量スペクトルを作成し(S15)、該スペクトルに基づいてPMF法などによりタンパク質を同定する(S16、S17)。これにより、複数種類のタンパク質が混在している場合でも、同定精度を高めることができる。 
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)