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1. (WO2008087324) MÉTHODE CORRECTRICE DE TRAITEMENT DE RÉSULTATS D'EXPÉRIENCES TRANSCRIPTOMIQUES OBTENUS PAR ANALYSE DIFFÉRENTIELLE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2008/087324    N° de la demande internationale :    PCT/FR2007/052562
Date de publication : 24.07.2008 Date de dépôt international : 19.12.2007
CIB :
G06F 19/20 (2011.01), G06F 19/24 (2011.01)
Déposants : GALDERMA RESEARCH & DEVELOPMENT [FR/FR]; 2400, route des Colles, Les Templiers, F-06410 Biot (FR) (Tous Sauf US).
FOGEL, Paul [FR/FR]; (FR) (US Seulement).
ZUGAJ, Didier [FR/FR]; (FR) (US Seulement).
LE GOFF, Jean-Marc [FR/FR]; (FR) (US Seulement)
Inventeurs : FOGEL, Paul; (FR).
ZUGAJ, Didier; (FR).
LE GOFF, Jean-Marc; (FR)
Mandataire : ANDRAL, Christophe; L'Oréal, River Plaza - DIPI, 25-29, quai Aulagnier, F-92665 Asnieres-sur-Seine (FR)
Données relatives à la priorité :
0655660 19.12.2006 FR
Titre (EN) CORRECTIVE METHOD FOR PROCESSING THE RESULTS OF TRANSCRIPTOMIC EXPERIMENTS OBTAINED BY DIFFERENTIAL ANALYSIS
(FR) MÉTHODE CORRECTRICE DE TRAITEMENT DE RÉSULTATS D'EXPÉRIENCES TRANSCRIPTOMIQUES OBTENUS PAR ANALYSE DIFFÉRENTIELLE
Abrégé : front page image
(EN)The invention relates to a corrective method for processing the results of transcriptomic experiments obtained by differential analysis, wherein said method comprises the following steps: obtaining results of the gene expression level in reference conditions and calculating the average expression level of each of said genes; obtaining results of the gene expression level in processing conditions and calculating the average expression level of each of said genes; calculating the modulation coefficient of the expression level for each of said genes; calculating a p-value associated with each modulation coefficient; and calculating p-value isobar curves according to the average expression level of each of said genes in the reference condition; calculating and associating a medium modulation coefficient on the isobar curve of each p-value observed. The invention can particularly be used for processing the results of experiments on DNA chips.
(FR)L'invention concerne une méthode correctrice de traitement de résultats d'expériences transcriptomiques obtenus par analyse différentielle. L'invention qui comporte les étapes suivantes: on obtient des résultats du niveau d'expression de gènes dans une condition de référence, et on calcule le niveau moyen d'expression de chacun desdits gènes; on obtient des résultats du niveau d'expression desdits gènes dans une condition de traitement, et on calcule le niveau moyen d'expression pour chacun desdits gènes; on calcule le coefficient de modulation du niveau d'expression pour chacun desdits gènes; on calcule une p-value associée à chaque coefficient de modulation; et on calcule des courbes isobares de p-value en fonction du niveau moyen d'expression de chacun desdits gènes dans la condition de référence; on calcule et on associe un coefficient de modulation médian sur la courbe isobare de chaque p- value observée. L'invention s'applique en particulier au traitement de résultats d'expériences pratiquées sur des puces à ADN.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : français (FR)
Langue de dépôt : français (FR)