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1. (WO2008005559) STRATÉGIE SERVANT À DÉTECTER DES MUTATIONS DE FAIBLE ABONDANCE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2008/005559    N° de la demande internationale :    PCT/US2007/015631
Date de publication : 10.01.2008 Date de dépôt international : 09.07.2007
CIB :
C12P 19/34 (2006.01)
Déposants : JOHNS HOPKINS UNIVERSITY [US/US]; 100 North Charles Street, 5th Floor, Baltimore, Maryland 21201 (US) (Tous Sauf US).
GOGGINS, Michael [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : GOGGINS, Michael; (US)
Mandataire : AXELROD, Nancy J.; VENABLE LLP, P.O. Box 34385, Washington, District Of Columbia 20043-9998 (US)
Données relatives à la priorité :
60/819,440 07.07.2006 US
Titre (EN) A STRATEGY FOR DETECTING LOW ABUNDANCE MUTATIONS
(FR) STRATÉGIE SERVANT À DÉTECTER DES MUTATIONS DE FAIBLE ABONDANCE
Abrégé : front page image
(EN) The present invention relates, e.g., to a method for screening for mutations in a DNA sample, comprising (a) diluting and distributing the sample to obtain a plurality of aliquots which, on the average, contain between about 2-10 genome equivalents of the DNA; (b) PCR amplifying the DNA in a sufficient number of aliquots, with at least one set of PCR primers, so as to generate amplicons such that, if mutations are present at a frequency of about 1-10% in a given gene in the sample, the probability of there being a mutation in that gene in at least one of the amplicons is at least about 95%; and (c) screening the amplicons for the presence of mutations, using a method that can detect unspecified mutations at unspecified sites within an amplicon (e.g., temperature gradient capillary electrophoresis (TGCE) or cycle sequencing of the DNA).
(FR)La présente invention concerne, par exemple, un procédé servant à rechercher par criblage des mutations dans un échantillon d'ADN, ledit procédé consistant à (a) diluer et diviser l'échantillon pour obtenir une pluralité de petites quantités d'échantillon qui, en moyenne, contiennent entre environ 2 et 10 équivalents génome de l'ADN ; (b) amplifier par ACP l'ADN dans un nombre suffisant de petites quantités d'échantillon, avec au moins un ensemble d'amorces pour ACP, de façon à générer des amplicons tels que, si des mutations sont présentes à une fréquence d'environ 1-10 % dans un gène donné présent dans l'échantillon, la probabilité qu'il y ait une mutation dans ce gène dans au moins l'un des amplicons soit d'au moins 95 % ; et (c) cribler les amplicons en ce qui concerne la présence de mutations, en utilisant un procédé qui peut détecter des mutations non spécifiées au niveau de sites non spécifiés à l'intérieur d'un amplicon (par exemple par électrophorèse capillaire à gradient de température (TGCE) ou séquençage cyclique de l'ADN).
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)