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1. WO2008005459 - PROCÉDÉS DE FRAGMENTATION ET DE MARQUAGE D'ACIDES NUCLÉIQUES

Numéro de publication WO/2008/005459
Date de publication 10.01.2008
N° de la demande internationale PCT/US2007/015409
Date du dépôt international 02.07.2007
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
C12P 19/34 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
PPROCÉDÉS DE FERMENTATION OU PROCÉDÉS UTILISANT DES ENZYMES POUR LA SYNTHÈSE D'UN COMPOSÉ CHIMIQUE DONNÉ OU D'UNE COMPOSITION DONNÉE, OU POUR LA SÉPARATION D'ISOMÈRES OPTIQUES À PARTIR D'UN MÉLANGE RACÉMIQUE
19Préparation de composés contenant des radicaux saccharide
26Préparation d'hydrates de carbone contenant de l'azote
28N-glucosides
30Nucléotides
34Polynucléotides, p.ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C12N 9/00 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
9Enzymes, p.ex. ligases (6.); Proenzymes; Compositions les contenant; Procédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
G01N 33/00 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
33Recherche ou analyse des matériaux par des méthodes spécifiques non couvertes par les groupes G01N1/-G01N31/146
C07H 21/02 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
07CHIMIE ORGANIQUE
HSUCRES; LEURS DÉRIVÉS; NUCLÉOSIDES; NUCLÉOTIDES; ACIDES NUCLÉIQUES
21Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p.ex. acides nucléiques
02avec le ribosyle comme radical saccharide
C07H 21/04 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
07CHIMIE ORGANIQUE
HSUCRES; LEURS DÉRIVÉS; NUCLÉOSIDES; NUCLÉOTIDES; ACIDES NUCLÉIQUES
21Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p.ex. acides nucléiques
04avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
CPC
C12Q 1/6806
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6806Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
C12Q 1/6811
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6811Selection methods for production or design of target specific oligonucleotides or binding molecules
Déposants
  • NUGEN TECHNOLOGIES, INC. [US]/[US] (AllExceptUS)
  • KURN, Nurith [IL]/[US] (UsOnly)
  • CHEN, Pengchin [US]/[US] (UsOnly)
Inventeurs
  • KURN, Nurith
  • CHEN, Pengchin
Mandataires
  • REAMEY, Robert, H.
Données relatives à la priorité
60/817,89030.06.2006US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHODS FOR FRAGMENTATION AND LABELING OF NUCLEIC ACIDS
(FR) PROCÉDÉS DE FRAGMENTATION ET DE MARQUAGE D'ACIDES NUCLÉIQUES
Abrégé
(EN)
The invention provides methods, compositions, and kits for fragmentation and labeling of nucleic acids. More particularly, the invention relates to methods for fragmentation of nucleic acids to produce fragments with 3' end hydroxyl groups within a desired size range. In methods of the invention, nucleic acids are fragmented at abasic sites to produce fragments with blocked 3' ends. The 3' ends are unblocked to produce polynucleotide fragments with hydroxyl groups at their 3' ends. Methods, kits, and compositions for carrying out fragmentation of a polynucleotide template in a single reaction mixture to yield fragments with 3'-hydroxl ends within the desired size range are disclosed.
(FR)
La présente invention concerne des procédés, des compositions et des trousses permettant de fragmenter et de marquer des acides nucléiques. Cette invention porte plus particulièrement sur des procédés de fragmentation d'acides nucléiques servant à produire des fragments ayant des groupes hydroxyle terminaux 3' qui se situent dans une plage de dimensions désirées. Dans les procédés selon l'invention, les acides nucléiques sont fragmentés au niveau de sites abasiques pour produire des fragments ayant les extrémités 3' bloquées. Les extrémités 3' sont débloquées pour produire des fragments polynucléotidiques ayant des groupes hydroxyle au niveau de leurs extrémités 3'. Cette invention concerne également des procédés, des trousses et des compositions permettant d'effectuer la fragmentation d'une matrice polynucléotidique dans un mélange de réaction unique pour produire des fragments à extrémités hydroxyle 3' dont les dimensions se situent dans la plage de dimensions désirées.
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