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1. (WO2008004691) appareil pour concevoir des amorces d'amplification d'acides nucléiques, programme pour concevoir des amorces et appareil de serveur pour concevoir des amorces
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2008/004691    N° de la demande internationale :    PCT/JP2007/063632
Date de publication : 10.01.2008 Date de dépôt international : 03.07.2007
CIB :
G06F 19/22 (2011.01), C12N 15/09 (2006.01)
Déposants : SHIMADZU CORPORATION [JP/JP]; 1, Nishinokyo-Kuwabaracho Nakagyo-ku, Kyoto-shi Kyoto 6048511 (JP) (Tous Sauf US).
RIKEN [JP/JP]; 2-1, Hirosawa Wako-shi Saitama 3510198 (JP) (Tous Sauf US).
TOPPAN PRINTING CO., LTD. [JP/JP]; 5-1, Taito 1-chome Taito-ku Tokyo 1100016 (JP) (Tous Sauf US).
NAKAMURA, Yusuke [JP/JP]; (JP) (US Seulement).
KONOSHITA, Ryu [JP/JP]; (JP) (US Seulement).
OGATA, Koretsugu [JP/JP]; (JP) (US Seulement)
Inventeurs : NAKAMURA, Yusuke; (JP).
KONOSHITA, Ryu; (JP).
OGATA, Koretsugu; (JP)
Mandataire : OKADA, Masahiro; OKADA & CO. 12th Shinko Bldg. 10F 1-6, Zaimoku-cho Chuo-ku, Osaka-shi Osaka 5400010 (JP)
Données relatives à la priorité :
2006-184992 04.07.2006 JP
Titre (EN) APPARATUS FOR DESIGNING NUCLEIC ACID AMPLIFICATION PRIMERS, PROGRAM FOR DESIGNING PRIMERS AND SERVER APPARATUS FOR DESIGNING PRIMERS
(FR) appareil pour concevoir des amorces d'amplification d'acides nucléiques, programme pour concevoir des amorces et appareil de serveur pour concevoir des amorces
(JA) 核酸増幅用プライマー設計装置、プライマー設計プログラム、及びプライマー設計サーバ装置
Abrégé : front page image
(EN)It is intended to provide an apparatus for designing primers, whereby an appropriate primer never forming any undesired nucleic acid fragment due caused by the binding of the primer to an unintended part in a nucleic acid amplification reaction can be designed, a program for designing primers and a server apparatus for designing primers. Namely, a program for designing primers aiming at computerizing the procedure for determining a series of primers to be used in amplifying a plural number of sequences in a nucleic acid, wherein a series of primers to be used in amplifying a plural number of sequences in a nucleic acid are determined by, for each potential combination in selecting two sites from among multiple sites to be amplified, computing and scoring the complementary between the sequence of a candidate primer for one of the two sites and the sequence of an amplification product obtained at the other sites of the two sites.
(FR)L'invention concerne un appareil pour concevoir des amorces, grâce auquel peut être conçue une amorce appropriée ne formant jamais de fragment d'acide nucléique indésirable causé par la liaison de l'amorce à une partie imprévue dans une réaction d'amplification d'acide nucléique, un programme pour concevoir des amorces et un appareil de serveur pour concevoir des amorces. L'invention concerne donc un programme pour concevoir des amorces visant à informatiser la procédure pour déterminer une série d'amorces à utiliser pour amplifier plusieurs séquences dans un acide nucléique, une série d'amorces à utiliser pour amplifier plusieurs séquences dans un acide nucléique étant déterminée, pour chaque combinaison potentielle dans la sélection de deux sites parmi des sites multiples à amplifier, par le calcul et la notation du complémentaire entre la séquence d'une amorce candidate pour un des deux sites et la séquence d'un produit d'amplification obtenue au niveau de l'autre site.
(JA)核酸増幅反応において、プライマーが意図しない場所への結合することによって不所望な核酸の断片を生じることがない、適切なプライマーを設計することができるプライマー設計装置、プライマー設計プログラム、及びプライマー設計サーバ装置を提供する。核酸中の複数の配列を増幅するための一連のプライマーを決定する処理をコンピュータに行わせるための、プライマー設計プログラムであって、複数の増幅すべき部位から2つの部位を選択する場合の全ての組み合わせについて、2つの部位のうち一方の部位についてのプライマー候補の配列と、2つの部位のうち他方の部位において得られる増幅産物の配列との相補性を計算しスコア化することを実行することによって、核酸中の複数の配列を増幅するための一連のプライマーを決定する、プライマー設計プログラム。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MT, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)