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1. WO2007139598 - PROFILAGE DES GÈNES ASSOCIÉS AUX MÉTASTASES POUR L'IDENTIFICATION DE TISSUS TUMORAUX, SOUS-TYPAGE ET PRÉDICTION DU PRONOSTIC DE PATIENTS

Numéro de publication WO/2007/139598
Date de publication 06.12.2007
N° de la demande internationale PCT/US2007/003516
Date du dépôt international 09.02.2007
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
C12P 19/34 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
PPROCÉDÉS DE FERMENTATION OU PROCÉDÉS UTILISANT DES ENZYMES POUR LA SYNTHÈSE D'UN COMPOSÉ CHIMIQUE DONNÉ OU D'UNE COMPOSITION DONNÉE, OU POUR LA SÉPARATION D'ISOMÈRES OPTIQUES À PARTIR D'UN MÉLANGE RACÉMIQUE
19Préparation de composés contenant des radicaux saccharide
26Préparation d'hydrates de carbone contenant de l'azote
28N-glucosides
30Nucléotides
34Polynucléotides, p.ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
CPC
C12Q 1/6886
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6883for diseases caused by alterations of genetic material
6886for cancer
C12Q 2600/112
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
112Disease subtyping, staging or classification
C12Q 2600/118
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
118Prognosis of disease development
Déposants
  • AdvPharma, Inc. [--/--]; 6F, No 90, Hsin-Tai Wu Road Sec. 1, His-Chih Town Taipei Hsien 221, TW (AllExceptUS)
  • STASON PHARMACEUTICALS, INC. [US/US]; 11 Morgan Irvine, CA 92618-2005, US (AllExceptUS)
  • CHOU, Yeh-Tze [--/--]; TW (UsOnly)
  • TERNG, Harn-Jing [--/--]; TW (UsOnly)
  • CHEN, Hsuan-Yu [--/--]; TW (UsOnly)
  • YU, Sung-Liang [--/--]; TW (UsOnly)
  • CHEN, Jeremy, J.W. [--/--]; TW (UsOnly)
  • YANG, Pan-Chyr [--/--]; TW (UsOnly)
Inventeurs
  • CHOU, Yeh-Tze; TW
  • TERNG, Harn-Jing; TW
  • CHEN, Hsuan-Yu; TW
  • YU, Sung-Liang; TW
  • CHEN, Jeremy, J.W.; TW
  • YANG, Pan-Chyr; TW
Mandataires
  • GARRETT, Arthur, S. ; Finnegan, Henderson, Farabow, Garrett & Dunner L.L.P. 901 New York Ave., N.W. Washington, DC 20001-4413, US
Données relatives à la priorité
11/437,60722.05.2006US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METASTASIS-ASSOCIATED GENE PROFILING FOR IDENTIFICATION OF TUMOR TISSUE, SUBTYPING, AND PREDICTION OF PROGNOSIS OF PATIENTS
(FR) PROFILAGE DES GÈNES ASSOCIÉS AUX MÉTASTASES POUR L'IDENTIFICATION DE TISSUS TUMORAUX, SOUS-TYPAGE ET PRÉDICTION DU PRONOSTIC DE PATIENTS
Abrégé
(EN)
The present invention provides methods using a gene expression profiling analysis (1) to determine whether a human sample is a tumor using a gene set containing nucleic acid sequences of SEQ ID NOS: 1-7, 8-17 or 1-17; (2) to identify whether a tumor tissue is an adenocarcinoma (using a gene set containing nucleic acid sequences of SEQ ID NOS: 15, 18- 21) or a squamous cell carcinoma (using a gene set containing nucleic acid sequences of SEQ ID NOS: 22-27); and (3) to predict the prognosis of survival and metastasis in humans with cancer (using a gene set containing nucleic acid sequences of SEQ ID NOS: 19, 28-42 or SEQ ID NOS: 19, 29, 31, 40, and 42), particularly for those humans who are at the early stage of lung cancer. The gene expression profiling is preferably performed by cDNA microarray- based techniques and/or Real-Time Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (Real- Time RT-PCR), and analyzed by statistical means.
(FR)
La présente invention concerne des procédés utilisant une analyse par profilage de l'expression génique dans les buts suivants : (1) déterminer si un échantillon d'origine humaine est une tumeur (à l'aide d'un ensemble de gènes contenant les séquences d'acide nucléique SEQ ID n° : 1 à 7, 8 à 17 ou 1 à 17); (2) identifier si un tissu tumoral est un adénocarcinome (à l'aide d'un ensemble de gènes contenant les séquences d'acide nucléique SEQ ID n° : 15, 18 à 21) ou un carcinome de cellules squameuses (à l'aide d'un jeu de gènes contenant les séquences d'acide nucléique SEQ ID n° : 22 à 27); et (3) prédire le pronostic de survie et de métastase chez des êtres humains atteints d'un cancer (à l'aide d'un ensemble de gènes contenant les séquences d'acide nucléique SEQ ID n° : 19, 28 à 42 ou SEQ ID n° : 19, 29, 31, 40 et 42), en particulier chez des patients humains à un stade précoce d'un cancer du poumon. Le profilage de l'expression génique est de préférence effectué à l'aide de procédés à base de réseaux d'ADNc et/ou d'une réaction de transcription inverse/amplification en chaîne par polymérase en temps réel (RT-PCR en temps réel), puis analysé par des moyens statistiques.
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