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1. (WO2007098130) STRATÉGIE INNOVANTE DE DÉCONVOLUTION ET DE FUSION POUR CRIBLAGE À GRANDE ÉCHELLE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2007/098130    N° de la demande internationale :    PCT/US2007/004313
Date de publication : 30.08.2007 Date de dépôt international : 16.02.2007
CIB :
G06F 19/00 (2006.01)
Déposants : THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA [US/US]; 1111 Franklin Street, 12th Floor, Oakland, California 94607-5200 (US) (Tous Sauf US).
PURDUE RESEARCH FOUNDATION [US/US]; Purdue Research Foundation, 3000 Kent Avenue, West Lafayette, Indiana 47906-1075 (US) (Tous Sauf US).
HUANG, Jing [US/US]; (US) (US Seulement).
JIN, Fulai [CN/US]; (US) (US Seulement).
HAZBUN, Tony R. [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : HUANG, Jing; (US).
JIN, Fulai; (US).
HAZBUN, Tony R.; (US)
Mandataire : PARENT, Annette S.; Townsend and Townsend and Crew LLP, Two Embarcadero Center, 8th Floor, San Francisco, California 94111 (US)
Données relatives à la priorité :
60/774,317 16.02.2006 US
Titre (EN) NOVEL POOLING AND DECONVOLUTION STRATEGY FOR LARGE SCALE SCREENING
(FR) STRATÉGIE INNOVANTE DE DÉCONVOLUTION ET DE FUSION POUR CRIBLAGE À GRANDE ÉCHELLE
Abrégé : front page image
(EN)Embodiments of the present invention provide methods, systems, kits, and apparatus for data analysis to detect interactions between atoms, molecules and/or cells. One embodiment of the present invention provides for a novel pooling-deconvolution strategy that can dramatically decrease the effort required to generate large-scale data sets. This 'PI-Deconvolution' strategy employs an N-digit base-X imaginary coding of XN probe proteins (baits or preys) and allows the screening of the baits in X*N pools, with N replicates for each bait. Deconvolution of proteins with their binding partners can be achieved by reading the prey's profile from the X*N experiments. The method can be used to screen XN bait or prey proteins.
(FR)Des exemples de mode de réalisation de la présente invention concernent des méthodes, des systèmes, des kits et des appareils d'analyse de données pour détecter des interactions entre atomes, molécules et/ou cellules. Un exemple de mode de réalisation de la présente invention concerne une stratégie innovante de fusion-déconvolution pouvant réduire de façon spectaculaire le travail nécessaire pour créer des jeux de données à grande échelle. Cette stratégie de “ PI-déconvolution ” utilise un codage imaginaire base X sur N chiffres de XN protéines sonde (amorces ou proies) et permet le criblage des amorces dans X*N fusions, avec N répliques pour chaque amorce. La déconvolution de protéines avec leurs partenaires de liaison peut être obtenue en lisant le profil de la proie à partir des X*N expériences. La méthode peut être utilisée pour cribler XN amorces ou protéines proie.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SV, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)