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1. (WO2006042036) METHODE ET SYSTEME D'IDENTIFICATION DE POLYPEPTIDES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2006/042036    N° de la demande internationale :    PCT/US2005/036027
Date de publication : 20.04.2006 Date de dépôt international : 06.10.2005
CIB :
G06F 19/22 (2011.01), G06F 19/28 (2011.01)
Déposants : APPLERA CORPORATION [US/US]; 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, California 94404 (US) (Tous Sauf US).
SHILOV, Ignat V. [UA/US]; (US) (US Seulement).
SEYMOUR, Sean L. [US/US]; (US) (US Seulement).
BONNER, Ron [CA/CA]; (CA) (US Seulement).
PATEL, Alpesh A. [CA/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : SHILOV, Ignat V.; (US).
SEYMOUR, Sean L.; (US).
BONNER, Ron; (CA).
PATEL, Alpesh A.; (US)
Mandataire : PASIKA, Hugh J.; 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, California 94404 (US)
Données relatives à la priorité :
60/616,656 06.10.2004 US
Titre (EN) METHOD AND SYSTEM FOR IDENTIFYING POLYPEPTIDES
(FR) METHODE ET SYSTEME D'IDENTIFICATION DE POLYPEPTIDES
Abrégé : front page image
(EN)The present teachings provide for identification of peptides using small sequences tags to focus computational resources on searching regions of a protein database that are the most likely to yield correct identifications. They allow for the incorporation of modifications and in doing so focuses the search to peptides with a precursor mass match. Additionally, probability or relevance factors can be used to determine peptide hypotheses. Various embodiments are presented that search for peptides when a single precursor is selected or when multiple precursor are simultaneously fragmented.
(FR)La présente invention concerne l'identification de peptides au moyen de marqueurs de petites séquences, la démarche consistant à concentrer les ressources de calcul sur l'analyse des zones de bases de données les plus susceptibles de fournir des identifications correctes. Il est ainsi possible d'intégrer des modifications et, par là même, de mettre l'accent sur la recherche de peptides appariés à une masse précurseur. De plus, il est possible d'utiliser des facteurs de probabilité ou de pertinence pour établir des hypothèses quant aux peptides. Sont décrits divers modes de réalisation portant sur la recherche de peptides dans le cas ou un seul précurseur est sélectionné ou lorsque de multiples précurseurs sont fragmentés simultanément.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, LY, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)