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1. (WO2005081166) APPAREIL DE PRÉDICTION DE SITE D’INTERACTION, MÉTHODE DE PRÉDICTION DE SITE D’INTERACTION, PROGRAMME ET SUPPORT D’ENREGISTREMENT
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2005/081166    N° de la demande internationale :    PCT/JP2005/003047
Date de publication : 01.09.2005 Date de dépôt international : 24.02.2005
CIB :
C40B 30/04 (2006.01), G01N 33/48 (2006.01), G01N 33/68 (2006.01), G06F 19/18 (2011.01), G06F 19/16 (2011.01), G06F 19/28 (2011.01)
Déposants : In-Silico Sciences, Inc. [JP/JP]; 15-9, Higashiyukigaya 2-chome, Ota-ku, Tokyo 1450065 (JP) (Tous Sauf US).
UMEYAMA, Hideaki [JP/JP]; (JP) (US Seulement).
SHITAKA, Mayuko [JP/JP]; (JP) (US Seulement).
TERASHI, Genki [JP/JP]; (JP) (US Seulement)
Inventeurs : UMEYAMA, Hideaki; (JP).
SHITAKA, Mayuko; (JP).
TERASHI, Genki; (JP)
Mandataire : SAKAI, Hiroaki; Sakai International Patent Office Kasumigaseki Building 2-5, Kasumigaseki 3-chome Chiyoda-ku, Tokyo 100-6019 (JP)
Données relatives à la priorité :
2004-048768 24.02.2004 JP
Titre (EN) INTERACTION SITE PREDICTING APPARATUS, METHOD OF INTERACTION SITE PREDICTION, PROGRAM AND RECORDING MEDIUM
(FR) APPAREIL DE PRÉDICTION DE SITE D’INTERACTION, MÉTHODE DE PRÉDICTION DE SITE D’INTERACTION, PROGRAMME ET SUPPORT D’ENREGISTREMENT
(JA) 相互作用部位予測装置、相互作用部位予測方法、プログラム、および記録媒体
Abrégé : front page image
(EN)It is intended to provide, for study of protein-protein interaction, an interaction site predicting apparatus, method of interaction site prediction, program and recording medium. Accordingly, a data base containing three-dimensional information and statistical information is created from information on known steric configurations of protein-protein complexes so as to enable analysis of protein-protein interaction. Further, with the use of this data base, there are accomplished with high precision prediction of the interaction site of protein in unknown steric configuration of protein-protein complex, prediction of the interaction site of protein whose steric configuration is unknown and prediction of relative positioning in the steric configuration of protein-protein complex. Still further, there are accomplished optimization of results of homology modeling of the steric configuration of multiple-chain protein and evaluation of alignment of the steric configuration of protein-protein complex for homology modeling.
(FR)Le but est de fournir, pour l’étude de l’interaction protéine-protéine, un appareil de prédiction de site d’interaction, une méthode de prédiction de site d’interaction, un programme et un support d’enregistrement. Par conséquent, une base de données contenant des informations tridimensionnelles et des informations statistiques est créée à partir d’informations sur des configurations stériques connues de complexes protéine-protéine de façon à permettre l’analyse de l’interaction protéine-protéine. En outre, une prédiction du site d’interaction d’une protéine de configuration stérique inconnue d’un complexe protéine-protéine, une prédiction du site d’interaction d’une protéine dont la configuration stérique est inconnue et une prédiction du positionnement relatif dans la configuration stérique d’un complexe protéine-protéine sont accomplies avec haute précision grâce à l’utilisation de cette base de données. En outre encore, sont accomplies l’optimisation des résultats d’une modélisation d’homologie de la configuration stérique d’une protéine à chaîne multiple et l’évaluation de l’alignement de la configuration stérique d’un complexe protéine-protéine pour modélisation d’homologie.
(JA) 本発明は、タンパク質−タンパク質相互作用を研究するため相互作用部位予測装置、相互作用部位予測方法、プログラム、および記録媒体を提供することを目的とする。本発明は、タンパク質−タンパク質複合体立体構造既知である情報から、タンパク質−タンパク質相互作用を解析できるようにするため、三次元情報や統計情報を含んだデータベースを作成する。また、本発明は、当該データベースを用いることで、タンパク質−タンパク質複合体立体構造が未知のタンパク質の相互作用部位予測や、立体構造が未知のタンパク質の相互作用部位予測、タンパク質−タンパク質複合体立体構造の相対位置予測を精度よく行い、複数鎖タンパク質立体構造のホモロジーモデリングの結果の最適化や、ホモロジーモデリングの為のタンパク質−タンパク質複合体立体のアライメントの評価を精度よく行う。
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)