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1. (WO2005066369) SEQUENCES NUCLEOTIDIQUES ETABLIES PAR CONTROLE RAMAN DE LA FIXATION DES NUCLEOTIDES EN REPLICATION MOLECULAIRE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international

N° de publication : WO/2005/066369 N° de la demande internationale : PCT/US2004/043633
Date de publication : 21.07.2005 Date de dépôt international : 28.12.2004
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
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BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
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Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
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faisant intervenir des acides nucléiques
Déposants :
INTEL CORPORATION [US/US]; 2200 Mission College Boulevard Santa Clara, CA 95052, US (AllExceptUS)
BERLIN, Andrew [US/US]; US (UsOnly)
SU, Xing [US/US]; US (UsOnly)
CHAN, Selena [US/US]; US (UsOnly)
KOO, Tae-Woong [KR/US]; US (UsOnly)
SUN, Lei [CN/US]; US (UsOnly)
SUNDARARAJAN, Narayan [KR/US]; US (UsOnly)
Inventeurs :
BERLIN, Andrew; US
SU, Xing; US
CHAN, Selena; US
KOO, Tae-Woong; US
SUN, Lei; US
SUNDARARAJAN, Narayan; US
Mandataire :
HAILE, Lisa, A. ; Gray Cary Ware and Freidenrich, LLP 4365 Executive Drive Suite 1100 San Diego, CA 92121, US
Données relatives à la priorité :
10/749,52730.12.2003US
Titre (EN) NUCLEIC ACID SEQUENCING BY RAMAN MONITORING OF UPTAKE OF NUCLEOTIDES DURING MOLECULAR REPLICATION
(FR) SEQUENCES NUCLEOTIDIQUES ETABLIES PAR CONTROLE RAMAN DE LA FIXATION DES NUCLEOTIDES EN REPLICATION MOLECULAIRE
Abrégé :
(EN) The methods and apparatus disclosed herein are useful for detecting nucleotides, nucleosides, and bases and for nucleic acid sequence determination. The methods involve detection of a nucleotide, nucleoside, or base using surface enhanced Raman spectroscopy (SERS) or surface enhanced coherent anti-Stokes Raman spectroscopy (SECARS). The detection can be part of a nucleic acid sequencing reaction to detect uptake of a deoxynucleotide triphosphate during a nucleic acid polymerization reaction, such as a nucleic acid sequencing reaction. The nucleic acid sequence of a synthesized nascent strand, and the complementary sequence of the template strand, can be determined by tracking the order of incorporation of nucleotides during the polymerization reaction. Methods for enhancing the SERS signal of a nucleotide or nucleoside by cleaving the base from a sugar moiety are provided. Furthermore, methods for detecting single base repeats are provided.
(FR) L'invention concerne des procédés et des dispositifs utiles pour la détection des nucléotides, des nucléosides, et des bases et pour la détermination des séquences nucléotidiques. Les procédés comportent la détection d'un nucléotide, d'un nucléoside ou d'une base par spectroscopie Raman améliorée (SERS) ou spectroscopie Raman anti-Stokes cohérente améliorée (SECARS). La détection peut s'inscrire dans une réaction de séquençage nucléotidique pour la détection de la fixation de désoxynucléotide triphosphate durant une réaction de polymérisation nucléotidique, du type réaction de séquençage nucléotidique. La séquence nucléotidique d'un brin naissant synthétisé, et la séquence complémentaire du brin complémentaire peuvent être déterminées par la détection de l'ordre d'incorporation nucléotidique durant la réaction de polymérisation. L'invention concerne également des procédé d'amélioration du signal SERS d'un nucléotide ou d'un nucléoside par clivage de la base depuis une fraction sucre. L'invention concerne également des procédés de détection de répétitions de bases uniques.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : Anglais (EN)
Langue de dépôt : Anglais (EN)
Également publié sous:
KR1020070000447EP1711626JP2007520215US20050147979CN1934271