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1. (WO2005042781) PROCEDES DE PRODUCTION D'UNE ETIQUETTE APPARIEE A PARTIR D'UNE SEQUENCE D'ACIDES NUCLEIQUES ET METHODES D'UTILISATION ASSOCIEES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2005/042781    N° de la demande internationale :    PCT/US2004/036141
Date de publication : 12.05.2005 Date de dépôt international : 29.10.2004
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 :    05.12.2005    
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : AGENCOURT PERSONAL GENOMICS CORPORATION [US/US]; 500 Cummings Center, Suite 2450, Beverly, MA 01915 (US) (Tous Sauf US).
SMITH, Douglas, R. [US/US]; (US) (US Seulement).
MALEK, Joel, A. [US/US]; (US) (US Seulement).
MCKERNAN, Kevin, J. [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : SMITH, Douglas, R.; (US).
MALEK, Joel, A.; (US).
MCKERNAN, Kevin, J.; (US)
Mandataire : COLLINS, Anne, J.; Hamilton, Brook, Smith & Reynolds, P.C., 530 Virginia Road, P.O. Box 9133, Concord, MA 01742-9133 (US)
Données relatives à la priorité :
60/516,080 31.10.2003 US
Titre (EN) METHODS FOR PRODUCING A PAIRED TAG FROM A NUCLEIC ACID SEQUENCE AND METHODS OF USE THEREOF
(FR) PROCEDES DE PRODUCTION D'UNE ETIQUETTE APPARIEE A PARTIR D'UNE SEQUENCE D'ACIDES NUCLEIQUES ET METHODES D'UTILISATION ASSOCIEES
Abrégé : front page image
(EN)Methods for producing a paired tag from a nucleic acid sequence are provided in which the paired tag comprises the 5' end tag and 3' end tag of the nucleic acid sequence. In one embodiment, the nucleic acid sequence comprises two restriction endonuclease recognition sites specific for a restriction endonuclease that cleaves the nucleic acid sequence distally to the restriction endonuclease recognition sites. In another embodiment, the nucleic acid sequence further comprises restriction endonuclease recognition sites specific for a rare cutting restriction endonuclease. Methods of using paired tags are also provided. In one embodiment, paired tags are used to characterize a nucleic acid sequence. In a particular embodiment, the nucleic acid sequence is a genome. In one embodiment, the characterization of a nucleic acid sequence is karyotyping. Alternatively, in another embodiment, the characterization of a nucleic acid sequence is mapping of the sequence. In a further embodiment, a method is provided for identifying nucleic acid sequences that encode at least two interacting proteins.
(FR)L'invention concerne des procédés de production d'une étiquette appariée à partir d'une séquence d'acides nucléiques dans laquelle l'étiquette appariée comprend l'étiquette terminale 5' et l'étiquette terminale 3'. Dans un mode de réalisation, la séquence d'acides nucléiques comprend deux sites de reconnaissance d'endonucléase de restriction, spécifiques d'une endonucléase de restriction qui clive la séquence d'acides nucléiques de manière distale par rapport aux sites de reconnaissance. Dans un autre mode de réalisation, la séquence d'acides nucléiques comprend également des sites de reconnaissance d'endonucléase de restriction, spécifiques d'une endonucléase de restriction rare. L'invention concerne également des méthodes d'utilisation d'étiquettes appariées. Dans un mode de réalisation, des étiquettes appariées sont utilisées pour caractériser une séquence d'acides nucléiques. Dans un mode de réalisation particulier, la séquence d'acides nucléiques est un génome. Dans un autre mode de réalisation, la caractérisation de la séquence d'acides nucléiques est un caryotypage. En variante, dans un autre mode de réalisation, la caractérisation de la séquence d'acides nucléiques est une cartographie de la séquence. Un autre mode de réalisation concerne un procédé d'identification de séquences d'acides nucléiques codant au moins deux protéines en interaction.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)