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1. (WO2005013077) SYSTEME ET PROCEDES D'ANALYSE DE DONNEES RELATIVES A DES MICRORESEAUX
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2005/013077    N° de la demande internationale :    PCT/US2004/024351
Date de publication : 10.02.2005 Date de dépôt international : 29.07.2004
CIB :
G01N 33/48 (2006.01)
Déposants : UNIVERSITY OF MEDICINE AND DENTISTRY OF NEW JERSEY [US/US]; 335 George Street, New Brunswick, NJ 08901 (US) (Tous Sauf US).
WELSH, William, J. [US/US]; (US) (US Seulement).
OUYANG, Ming [--/US]; (US) (US Seulement).
LIOY, Paul [US/US]; (US) (US Seulement).
GEORGOPOULOS, Panos [GR/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : WELSH, William, J.; (US).
OUYANG, Ming; (US).
LIOY, Paul; (US).
GEORGOPOULOS, Panos; (US)
Mandataire : LICATA, Jane, Massey; Licata & Tyrell P.C., 66 E. Main Street, Marlton, NJ 08053 (US)
Données relatives à la priorité :
60/491,635 30.07.2003 US
Titre (EN) SYSTEMS AND METHODS FOR MICROARRAY DATA ANALYSIS
(FR) SYSTEME ET PROCEDES D'ANALYSE DE DONNEES RELATIVES A DES MICRORESEAUX
Abrégé : front page image
(EN)Clustering is routinely applied in the exploratory analysis of microarray data. Missing entries arise from blemishes on the microarrays. The present invention provides a new method, and computer program and/or computer product thereof to impute missing values. The method involves the steps of clustering microarray data by partitioning the data into a select number of clusters, wherein each data point is iteratively moved from one cluster to another, until two consecutive iterations have resulted in the same partition pattern; obtaining a select number of estimates of the data in the clusters by probabilistic interference; and averaging the select number of estimates to obtain missing values in the microarray data. The method is superior to other imputation models as measured by root mean squared errors.
(FR)La technique du groupage est couramment appliquée à l'analyse exploratoire des données de microréseaux. Les entrées manquantes sont dues à des défectuosités sur les microréseaux. La présente invention concerne nouveau procédé assorti d'un programme informatique et/ou d'un produit d'ordinateur permettant d'entrer les valeurs manquantes. Ce procédé consiste: à grouper des données de microréseaux selon un nombre déterminé de groupes, chaque point de données étant déplacé itérativement d'un groupe à un autre jusqu'à ce que deux itérations consécutives se traduisent par le même schéma de partitionnement; à obtenir un certain nombre d'estimations des données dans les groupes par interférence probabiliste; et à faire la moyenne du nombre d'estimations choisi pour obtenir les valeurs manquantes dans les données de microréseau. Ce procédé est supérieur à d'autres modèles d'imputation mesurés en termes d'erreurs en valeur efficace.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NA, NI, NO, NZ, OM, PG, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SY, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)