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1. WO2004097712 - PROCEDE ET INTERFACE GRAPHIQUE D'UTILISATEUR POUR LA VISUALISATION D'INFORMATIONS GENOMIQUES

Numéro de publication WO/2004/097712
Date de publication 11.11.2004
N° de la demande internationale PCT/US2004/012977
Date du dépôt international 28.04.2004
CIB
G06F 19/26 2011.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
FTRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
26pour la visualisation de données, p.ex. production de graphiques, affichage de cartes ou de réseaux ou autres représentations visuelles
G06F 19/18 2011.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
FTRAITEMENT ÉLECTRIQUE DE DONNÉES NUMÉRIQUES
19Équipement ou méthodes de traitement de données ou de calcul numérique, spécialement adaptés à des applications spécifiques
10Bio-informatique, c. à d. procédés ou systèmes pour le traitement de données génétiques ou se rapportant aux protéines en biologie moléculaire informatique
18pour la génomique ou la protéomique fonctionnelle, p.ex. associations génotype-phénotype, déséquilibre de liaison, mutagénèse, génotypage ou annotation génomique, interactions protéines-protéines ou interactions protéines-acides nucléiques
CPC
G16B 20/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
G16B 45/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
45ICT specially adapted for bioinformatics-related data visualisation, e.g. displaying of maps or networks
Déposants
  • APPLERA CORPORATION [US]/[US] (AllExceptUS)
  • DE LA VEGA, Francisco, M. [MX]/[US] (UsOnly)
  • ISAAC, Hadar, I. [US]/[US] (UsOnly)
Inventeurs
  • DE LA VEGA, Francisco, M.
  • ISAAC, Hadar, I.
Mandataires
  • DALEY, Donald, J.
Données relatives à la priorité
60/466,31028.04.2003US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHODOLOGY AND GRAPHICAL USER INTERFACE TO VISUALIZE GENOMIC INFORMATION
(FR) PROCEDE ET INTERFACE GRAPHIQUE D'UTILISATEUR POUR LA VISUALISATION D'INFORMATIONS GENOMIQUES
Abrégé
(EN)
A method for displaying genomic information includes displaying a first axis representing a chromosome with units of basepairs. It also includes displaying on the first axis first and second sets of gene reference marks identifying genes located on forward and reverse strands of the chromosome. One or more sets of additional reference marks are further displayed, including genetic marker reference marks and haplotype reference marks. Each set of haplotype reference marks identifies one or more haplotype blocks for a population.
(FR)
L'invention concerne un procédé d'affichage d'informations génomiques consistant à afficher un premier axe représentant un chromosome doté d'unités de paires de base. Ledit procédé consiste également à afficher sur le premier axe des première et seconde séries de marques de référence géniques identifiant des gènes situés sur des brins avant et inverse du chromosome. Au moins une série de marques de référence supplémentaires est affichée, y compris des marques de référence de marqueur génétique et des marques de référence d'haplotype. Chaque série de marques de référence d'haplotype permet d'identifier au moins une séquence d'haplotype pour une population.
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