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1. WO2004058987 - AMPLIFICATION DE L'ACIDE NUCLEIQUE

Numéro de publication WO/2004/058987
Date de publication 15.07.2004
N° de la demande internationale PCT/US2003/040364
Date du dépôt international 19.12.2003
CIB
C07H 21/04 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
07CHIMIE ORGANIQUE
HSUCRES; LEURS DÉRIVÉS; NUCLÉOSIDES; NUCLÉOTIDES; ACIDES NUCLÉIQUES
21Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p.ex. acides nucléiques
04avec le désoxyribosyle comme radical saccharide
C12P 19/34 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
PPROCÉDÉS DE FERMENTATION OU PROCÉDÉS UTILISANT DES ENZYMES POUR LA SYNTHÈSE D'UN COMPOSÉ CHIMIQUE DONNÉ OU D'UNE COMPOSITION DONNÉE, OU POUR LA SÉPARATION D'ISOMÈRES OPTIQUES À PARTIR D'UN MÉLANGE RACÉMIQUE
19Préparation de composés contenant des radicaux saccharide
26Préparation d'hydrates de carbone contenant de l'azote
28N-glucosides
30Nucléotides
34Polynucléotides, p.ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
C12Q 1/6844
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6844Nucleic acid amplification reactions
Déposants
  • QIAGEN GMBH [DE]/[DE]
Inventeurs
  • LASKEN, Roger, S.
  • EGHOLM, Michael
  • ALSMADI, Osama, A.
  • BORNARTH, Carole
  • WISNIEWSKI, Michele
  • HOSONO, Seiyu
  • RAGHUNATHAN, Arumugham
Mandataires
  • NEEDLE, William, H.
Données relatives à la priorité
10/327,60220.12.2002US
10/429,22902.05.2003US
10/456,05606.06.2003US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) NUCLEIC ACID AMPLIFICATION
(FR) AMPLIFICATION DE L'ACIDE NUCLEIQUE
Abrégé
(EN)
Disclosed are compositions and a method for amplification of nucleic acid sequences of interest. The method is based on strand displacement replication of the nucleic acid sequences by primers. The disclosed method is a form of multiple displacement amplification (MDA) useful for amplifying genomic nucleic acid samples and other nucleic acid samples of high complexity. The disclosed method can be used to amplify such highly complex nucleic acid samples using only one or a limited number of primers. It has been discovered that one or a small number of primers can effectively amplify whole genomes an other nucleic acid samples of high sequence complexity. The primers are specially selected or designed to be able to prime and efficiently amplify the broad range of sequences present in highly complex nucleic acid samples despite the limited amount of primer sequence represented in the primers. It has been discovered that generation of high molecular weight artifacts, in an isothermal amplification procedure, is substantially reduced or eliminated while still allowing the desired amplification of input DNA by carrying out the reaction at a higher temperature and, optionally, in the presence of one or more additives. It has also bee discovered that amplification reactions can produce amplification products of high quality, such as low amplification bias, if performed on an amount of nucleic acid at or over a threshold amount and/or on nucleic acids at or below a threshold concentration.
(FR)
L'invention porte sur des compositions et sur un procédé d'amplification de séquences d'acide nucléique considérées. Ce procédé est basé sur la réplication par déplacement des brins des séquences d'acide nucléique au moyen d'amorces. Le procédé est une forme de l'amplification à déplacements multiples utile pour amplifier des échantillons génomiques de l'acide nucléique et autres échantillons d'acide nucléique de grande complexité. Le procédé de cette invention peut être utilisé pour amplifier ces échantillons d'acide nucléique extrêmement complexes au moyen d'une seule amorce ou d'un nombre limité d'amorces. Il s'avère qu'une amorce ou un petit nombre d'amorces peut effectivement amplifier la totalité des génomes et autres échantillons d'acide nucléique ayant une grande complexité de séquence. Les amorces sont notamment sélectionnées ou désignées pour pouvoir amorcer et amplifier efficacement la large plage de séquences présentes dans des échantillons d'acide nucléiques extrêmement complexes en dépit de la quantité limitée de séquences représentées dans les amorces. Il s'avère également que la génération d'artéfacts de poids moléculaire élevé, dans une procédure d'amplification isotherme, est sensiblement réduite ou éliminée, mais continue de permettre l'amplification désirée d'un ADN d'entrée en réalisant la réaction à une température plus élevée et, éventuellement, en présence d'un ou plusieurs additifs. Il s'avère aussi que les réactions d'amplification peuvent produire des produits d'amplification de haute qualité, comme une polarisation faible pendant l'amplification, si elles sont effectuées sur une quantité d'acide nucléique égale ou supérieure à un seuil et/ou sur des acides nucléiques dans une quantité égale ou inférieure à une concentration de seuil.
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