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1. WO2003107144 - SYSTEMES ET PROCEDES DE PREVISION DE TEMPERATURES DE FUSION D'OLIGONUCLEOTIDE (TMS)

Numéro de publication WO/2003/107144
Date de publication 24.12.2003
N° de la demande internationale PCT/US2003/019447
Date du dépôt international 18.06.2003
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 16.01.2004
CIB
C12Q 1/68 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
C07B 2200/11
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
BGENERAL METHODS OF ORGANIC CHEMISTRY; APPARATUS THEREFOR
2200Indexing scheme relating to specific properties of organic compounds
11Compounds covalently bound to a solid support
C07H 19/06
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
19Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides ; Anhydro-derivatives thereof
02sharing nitrogen
04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
06Pyrimidine radicals
C07H 19/10
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
19Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides ; Anhydro-derivatives thereof
02sharing nitrogen
04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
06Pyrimidine radicals
10with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
C07H 19/16
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
19Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides ; Anhydro-derivatives thereof
02sharing nitrogen
04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
16Purine radicals
C07H 19/20
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
19Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides ; Anhydro-derivatives thereof
02sharing nitrogen
04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
16Purine radicals
20with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
C07H 19/23
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
19Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides ; Anhydro-derivatives thereof
02sharing nitrogen
04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
23Heterocyclic radicals containing two or more heterocyclic rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring system, not provided for in groups C07H19/14 - C07H19/22
Déposants
  • EPOCH BIOSCIENCES, INC. [US]/[US]
Inventeurs
  • DEMPCY, Robert, O.
  • GALL, Alexander, A.
  • LOKHOV, Sergey, G.
  • AFONINA, Irina, A.
  • SINGER, Michael, J.
  • KUTYAVIN, Igor, V.
  • VERMEULEN, Nicolaas, M., J.
Mandataires
  • GRAY, Gerald, T.
Données relatives à la priorité
10/176,97218.06.2002US
Langue de publication Anglais (en)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) SYSTEMS AND METHODS FOR PREDICTING OLIGONUCLEOTIDE MELTING TEMPERATURES (TMS)
(FR) SYSTEMES ET PROCEDES DE PREVISION DE TEMPERATURES DE FUSION D'OLIGONUCLEOTIDE (TMS)
Abrégé
(EN) Software systems and methods for predicting the melting temperature (Tm) and other characteristics of oligonucleotides, including modified oligonucleotides. Modified oligonucleotides are provided containing bases selected from unsubstituted and 3-substituted pyrazolo[3,4-d]pyrimidines and 5-substituted pyrimidines, and optionally have attached minor groove binders and reporter groups.
(FR) L'invention concerne des systèmes et des procédés logiciels de prévision de la température de fusion (Tm) et d'autres caractéristiques d'oligonucléotides, notamment d'oligonucléotides modifés. Les oligonucléotides modifiés contiennent des bases choisies parmi des pyrazolo[3,4-d] pyrimidines non substituées et substituées en position 3 et des pyrimidines substituées en position 5, et possèdent éventuellement des liants de petits sillons et des groupes rapporteurs y étant fixés.
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