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1. (WO2003087774) MICRORESEAUX ECIST CONÇUS POUR EFFECTUER UN CRIBLAGE DOUBLE D'UNE HYPERMETHYLATION DE L'ADN ET D'UNE INACTIVATION GENIQUE, ET DESTINES A ETRE UTILISES DANS UN SYSTEME INTEGRE POUR EVALUER UNE EXPRESSION GENIQUE, UNE METHYLATION DE L'ADN ET UNE ACETYLATION D'HISTONE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2003/087774    N° de la demande internationale :    PCT/US2003/011598
Date de publication : 23.10.2003 Date de dépôt international : 14.04.2003
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : CURATORS OF THE UNIVERSITY OF MISSOURI [US/US]; Office of Technology and Special Projects, University of Missouri-Columbia, 615 Locust Street Building, Third Floor, Columbia, MO 65211-1400 (US) (Tous Sauf US).
HUANG, Tim, Hui-Ming [US/US]; (US) (US Seulement).
SHI, Huidong [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : HUANG, Tim, Hui-Ming; (US).
SHI, Huidong; (US)
Mandataire : DAVISON, Barry, L.; Davis Wright Tremaine LLP, 2600 Century Square, 1501 Fourth Avenue, Seattle, WA 98101-1688 (US)
Données relatives à la priorité :
60/372,140 12.04.2002 US
Titre (EN) ECIST MICROARRAYS FOR DUAL SCREENING OF DNA HYPERMETHYLATION AND GENE SILENCING
(FR) MICRORESEAUX ECIST CONÇUS POUR EFFECTUER UN CRIBLAGE DOUBLE D'UNE HYPERMETHYLATION DE L'ADN ET D'UNE INACTIVATION GENIQUE, ET DESTINES A ETRE UTILISES DANS UN SYSTEME INTEGRE POUR EVALUER UNE EXPRESSION GENIQUE, UNE METHYLATION DE L'ADN ET UNE ACETYLATION D'HISTONE
Abrégé : front page image
(EN)Novel methods are herein provided for high-throughput, dual analysis of DNA methylation and gene expression, and triple analysis of DNA methylation, gene expression and gene-associated histone acetylation in cancer cells using arrayed expressed CpG island sequence tags (ECISTs). ECISTs correspond to genomic DNA fragments comprising GC-rich segments along with promoter and/or exon (e.g., first exon) portions of genes. The GC-rich segments are useful for screening hypermethylated CpG sites in cancer cells, while the corresponding promoter and exon-containing portions are useful for determining corresponding transcript levels and assessing histone acetylation. Also provided are high-throughput methods for either confirming methylation-dependent gene silencing, or identifying therapeutically effective demethylating agents, using the ECIST array panels to identify hypermethylated loci, and measure expression levels thereof after cellular exposure to demethylating agents. Further provided are high-throughput methods for distinguishing between direct (primary) demethylation-dependent gene up-regulation, and indirect (secondary) demethylation-dependent up-regulation within apparent epigenetic cascades.
(FR)L'invention concerne de nouveaux procédés permettant d'effecteur une analyse double à haut rendement d'une méthylation de l'ADN et d'une expression génique, ainsi qu'une analyse triple d'une méthylation de l'ADN, d'une expression génique et d'une acétylation d'histone associée à un gène dans des cellules cancéreuses, au moyen de réseaux de marqueurs de séquences d'îlots CpG exprimées (ECIST). Les ECIST correspondent à des fragments d'ADN génomique comprenant des segments riches en GC ainsi que des parties de gènes de type promoteur et/ou exon (par ex. premier exon). Ces segments riches en GC peuvent servir à cribler des sites CpG hyperméthylés dans des cellules cancéreuses, tandis que les parties correspondantes qui comportent des promoteurs et des exons servent à déterminer des niveaux de transcription correspondants et à évaluer l'acétylation d'histone. L'invention se rapporte également à des procédés à rendement élevé permettant, soit de confirmer une inactivation génique liée à une méthylation, soit d'identifier des agents de déméthylation à efficacité thérapeutique, au moyen de panels de réseaux d'ECIST pour identifier des loci hyperméthylés, et mesurer leurs niveaux d'expression après une exposition cellulaire à des agents de déméthylation. L'invention concerne en outre des procédés à rendement élevé permettant d'établir une distinction entre une régulation positive génique directe (primaire) liée à une déméthylation et une régulation positive indirecte (secondaire) liée à une déméthylation au sein de cascades épigénétiques.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NI, NO, NZ, OM, PH, PL, PT, RO, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HU, IE, IT, LU, MC, NL, PT, RO, SE, SI, SK, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)