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1. WO2003018809 - ISOLEMENT DE PROTEINES IMPLIQUEES DANS L'EXTINCTION DE GENES POST-TRANSCRIPTIONNELLE ET METHODES D'UTILISATION

Numéro de publication WO/2003/018809
Date de publication 06.03.2003
N° de la demande internationale PCT/US2002/027300
Date du dépôt international 26.08.2002
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 24.03.2003
CIB
C12N 9/22 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
9Enzymes, p.ex. ligases (6.); Proenzymes; Compositions les contenant; Procédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
14Hydrolases (3.)
16agissant sur les liaisons esters (3.1)
22Ribonucléases
C12N 15/82 2006.1
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
63Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteurs; Vecteurs; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci; Régulation de l'expression
79Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
82pour cellules végétales
CPC
C12N 15/8218
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
82for plant cells ; , e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
8216Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
8218Antisense, co-suppression, viral induced gene silencing [VIGS], post-transcriptional induced gene silencing [PTGS]
C12N 15/8283
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
82for plant cells ; , e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
8261with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
8271for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
8279for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
8283for virus resistance
C12N 9/22
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
9Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof
14Hydrolases (3)
16acting on ester bonds (3.1)
22Ribonucleases ; RNAses, DNAses
Déposants
  • THE TEXAS A & M UNIVERSITY SYSTEM [US]/[US]
Inventeurs
  • MIRKOV, T., Erik
  • INGELBRECHT, Ivan, L.
Mandataires
  • WILLIAMS, Bradley, P.
  • GRUBERT, Andreas, H.
Données relatives à la priorité
10/226,71523.08.2002US
60/314,86324.08.2001US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) ISOLATION OF PROTEINS INVOLVED IN POSTTRANSCRIPTIONAL GENE SILENCING AND METHODS OF USE
(FR) ISOLEMENT DE PROTEINES IMPLIQUEES DANS L'EXTINCTION DE GENES POST-TRANSCRIPTIONNELLE ET METHODES D'UTILISATION
Abrégé
(EN)
The present invention includes a method for detecting and isolating sugarcane proteins that interact with the HC-Pro and P1 proteins of SrMV and other proteins involved in gene silencing, particularity in sugarcane. The method uses a two hybrid assay with an HC-Pro, P1, or other silencing-related protein-containing bait protein and a prey protein containing a polypeptide encoded by a DNA molecule in a cDNA library. The method also includes identification of false positives through reverse two-hybrid assays and using in vitro techniques such as farwestern blots or pull down assays where plant physiological conditions may be replicated. Finally, interactions may be confirmed in planta. Some novel proteins used in and discovered using these methods are also identified. Methods of using viral and plant proteins to regulate silencing in plants such as sugarcane are also discussed.
(FR)
La présente invention concerne une méthode de détection et d'isolement de protéines de canne à sucre qui interagissent avec les protéines HC-Pro et P1 du virus de la mosaïque du sorgho et autres protéines impliquées dans l'extinction de gènes, notamment dans la canne à sucre. Ladite méthode fait appel à une analyse à deux hybrides à l'aide d'une HC-Pro, d'une P1, ou d'une autre protéine appât contenant la protéine associée à l'extinction et d'une protéine proie contenant un polypeptide codé par une molécule d'ADN dans une bibliothèque d'ADNc. Ladite méthode consiste également à identifier des faux positifs à l'aide d'analyses à deux hybrides inverses et à l'aide de techniques in vitro telles que des techniques de transfert de type « farwestern » ou d'analyses par tirage où les conditions physiologiques de la plante peuvent se répliquer. Enfin, des interactions peuvent être confirmées in planta. L'invention concerne également l'identification de certaines protéines nouvelles utilisées dans lesdites méthodes et découvertes à l'aide desdites méthodes. L'invention concerne également des méthodes d'utilisation de protéines virales et végétales pour réguler l'extinction dans des plantes telles que la canne à sucre.
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