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1. WO2003007187 - PROCEDE D'EVALUATION DE LIGAND ET UTILISATION DE CE PROCEDE

Numéro de publication WO/2003/007187
Date de publication 23.01.2003
N° de la demande internationale PCT/JP2002/007057
Date du dépôt international 11.07.2002
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 20.08.2002
CIB
C07K 14/705 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
07CHIMIE ORGANIQUE
KPEPTIDES
14Peptides ayant plus de 20 amino-acides; Gastrines; Somatostatines; Mélanotropines; Leurs dérivés
435provenant d'animaux; provenant d'humains
705Récepteurs; Antigènes de surface cellulaire; Déterminants de surface cellulaire
CPC
C07K 14/705
CCHEMISTRY; METALLURGY
07ORGANIC CHEMISTRY
KPEPTIDES
14Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
435from animals; from humans
705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
Déposants
  • TAKEDA CHEMICAL INDUSTRIES, LTD. [JP/JP]; 1-1, Doshomachi 4-chome, Chuo-ku Osaka-shi, Osaka 541-0045, JP (AllExceptUS)
  • INOOKA, Hiroshi [JP/JP]; JP (UsOnly)
  • YAMAMOTO, Yoshio [JP/JP]; JP (UsOnly)
Inventeurs
  • INOOKA, Hiroshi; JP
  • YAMAMOTO, Yoshio; JP
Mandataires
  • KOBAYASHI, Hiroshi ; Fukuoka Bldg. 9th Fl. 8-7, Yaesu 2-chome Chuo-ku, Tokyo 104-0028, JP
Données relatives à la priorité
2001-21274912.07.2001JP
Langue de publication japonais (JA)
Langue de dépôt japonais (JA)
États désignés
Titre
(EN) METHOD OF PRESUMING LIGAND AND METHOD OF USING THE SAME
(FR) PROCEDE D'EVALUATION DE LIGAND ET UTILISATION DE CE PROCEDE
Abrégé
(EN)
A method for estimating a ligand or a ligand type directly binding (or coupling) to GPCR based on GPCR sequencial data and, in its turn, estimating its function. More specifically, a method of presuming a ligand of a protein with unknown ligand which comprises obtaining classification data of proteins with known ligands wherein the alignments of the proteins with known ligands correspond respectively to the ligands or ligand types, obtaining ligand−determining residue−ligand classification data which shows the correlationships among ligand−determining residues and ligands or ligand types to thereby obtain the alignments of proteins with unknown ligands, applying the data at least concerning the ligand−determining residues in the alignments of the proteins with unknown ligands as described above to the ligand−determining residue−ligand classification data, and thus estimating the ligand or ligand type of the protein with the unknown ligand, etc.
(FR)
La présente invention concerne un procédé permettant, sur la base des données séquentielles du récepteur couplé à la protéine G, d'estimer un ligand ou un type de ligand se liant ou se couplant directement au récepteur couplé à la protéine G, et par voie de conséquences, d'évaluer sa fonction. L'invention concerne plus particulièrement un procédé permettant d'évaluer un ligand d'une protéine avec un ligand inconnu. A cet effet, on se procure les données de classification des protéines à ligands connus pour lesquels les alignements des protéines avec les ligands connus correspondent, suivant le cas, aux ligands ou aux types de ligands. On se procure également données de classification des ligands de résidus déterminants pour les ligands, et qui font apparaître les corrélations entre résidus déterminants pour les ligands et ligands ou types de ligands, de façon à avoir les alignements des protéines avec les ligands inconnus. On prend les données concernant au moins les résidus déterminants pour les ligands dans les alignements des protéines avec les ligands tels que décrit précédemment, et on les applique aux données de classification des ligands de résidus déterminants pour les ligands, ce qui permet d'évaluer le ligand ou type de ligand de protéine portant le ligand inconnu.
Également publié en tant que
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