WIPO logo
Mobile | Deutsch | English | Español | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Recherche dans les collections de brevets nationales et internationales
World Intellectual Property Organization
Recherche
 
Options de navigation
 
Traduction
 
Options
 
Quoi de neuf
 
Connexion
 
Aide
 
Traduction automatique
1. (WO2002083923) PROCEDES DE QUANTIFICATION ET DE SEQUENÇAGE DE NOVO DE POLYPEPTIDES PAR SPECTROMETRIE DE MASSE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2002/083923    N° de la demande internationale :    PCT/US2002/011738
Date de publication : 24.10.2002 Date de dépôt international : 12.04.2002
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 :    13.11.2002    
CIB :
G01N 33/68 (2006.01)
Déposants : THE INSTITUTE FOR SYSTEMS BIOLOGY [US/US]; 1441 North 34th Street, Seattle, WA 98103-8904 (US) (Tous Sauf US).
GOODLETT, David, R. [US/US]; (US) (US Seulement).
KELLER, Andrew [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : GOODLETT, David, R.; (US).
KELLER, Andrew; (US)
Mandataire : GAY, David, A.; Campbell & Flores LLP, 4370 La Jolla Village Drive, 7th Floor, San Diego, CA 92122 (US)
Données relatives à la priorité :
09/835,072 13.04.2001 US
Titre (EN) METHODS FOR QUANTIFICATION AND DE NOVO POLYPEPTIDE SEQUENCING BY MASS SPECTROMETRY
(FR) PROCEDES DE QUANTIFICATION ET DE SEQUENÇAGE DE NOVO DE POLYPEPTIDES PAR SPECTROMETRIE DE MASSE
Abrégé : front page image
(EN)This invention provides a method of determining an amino acid sequence of a parent polypeptide. The method consists of: (a) obtaining mass spectra of two or more differentially labeled polypeptide fragments of a parent polypeptide; (b) assigning a mass and a weighting characteristic to two or more paired signals having mass difference; (c) selecting from the mass spectra a paired signal having the assigned mass and a weighting characteristic distinguishable from non-peptide signals; (d) determining the difference in mass of the polypeptide fragments; (e) assigning the mass differences; and (f) orienting the assigned amino acid names. Also, provided is a method of determining the amino acid sequence of a polypeptide consisting of: (a) constructing a graph from mass spectra of two or more differentially labeled polypeptides; (b) creating a node corresponding to a paired signal; and (c) adding a labeled weighted directed edge to the graph between any two nodes.
(FR)La présente invention se rapporte à un procédé de détermination d'une séquence d'acides aminés d'un polypeptide parent. Ledit procédé consiste à: (a) obtenir des spectres de masse d'au moins deux fragments polypeptidiques marqués de manière différentielle d'un polypeptide parent; (b) attribuer une masse et une caractéristique de pondération à au moins deux signaux appariés ayant une différence de masse correspondant à une valeur entière dudit marqueur différentiel, la caractéristique de pondération combinant les propriétés de chaque signal au sein de la paire de signaux; (c) sélectionner à partir des masses spectrales un signal apparié ayant la masse attribuée et une caractéristique de pondération pouvant être distinguée des signaux non peptidiques, la masse attribuée indiquant la masse d'un fragment polypeptidique au sein des spectres; (d) déterminer la différence de masse des fragments polypeptidiques; (e) attribuer aux différences de masse un nom d'acide aminé satisfaisant et (f) orienter les noms d'acides aminés attribués. L'invention se rapporte également à un procédé de détermination de la séquence d'acides aminés d'un polypeptide. Ledit procédé consiste à: (a) construire un graphe à partir des spectres de masse d'au moins deux polypeptides marqués de manière différentielle, ledit graphe comportant un noeud avec une masse <i>m</i>, un nombre de marqueurs <i>n</i>, une intensité <i>i</i>, et une différence de masse des marqueurs <i>$g(D)</i>; (b) créer un noeud correspondant au signal apparié ayant des masses comprises approximativement entre m et m+n$g(D); et (c) ajouter au graphe une limite orientée, pondérée et marquée entre deux noeuds quelconques correspondant à une masse d'un acide aminé, ladite limite orientée, pondérée et marquée combinant les propriétés des signaux appariés.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, OM, PH, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)