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1. (WO2002079872) PROCEDES DE PREDICTION AB INITIO D'HELICES ALPHA, DE FEUILLETS BETA, ET DE STRUCTURES TERTIAIRES POLYPEPTIDIQUES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2002/079872    N° de la demande internationale :    PCT/US2002/004644
Date de publication : 10.10.2002 Date de dépôt international : 19.02.2002
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 :    16.09.2002    
CIB :
G06F 19/16 (2011.01), G06F 19/22 (2011.01)
Déposants : THE TRUSTESS OF PRINCETON UNIVERSITY [US/US]; P.O. Box 36, 5 New South Building, Princeton, NJ 08544 (US) (Tous Sauf US).
FLOUDAS, Christopher, A. [US/US]; (US) (US Seulement).
KLEPEIS, John, L. [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : FLOUDAS, Christopher, A.; (US).
KLEPEIS, John, L.; (US)
Mandataire : CALDWELL, John, W.; Woodcock Washburn LLP, 46th Floor, One Liberty Place, Philadelphia, PA 19103 (US)
Données relatives à la priorité :
09/788,006 16.02.2001 US
Titre (EN) METHODS OF AB INITIO PREDICTION OF ALPHA HELICES, BETA SHEETS, AND POLYPEPTIDE TERTIARY STRUCTURES
(FR) PROCEDES DE PREDICTION AB INITIO D'HELICES ALPHA, DE FEUILLETS BETA, ET DE STRUCTURES TERTIAIRES POLYPEPTIDIQUES
Abrégé : front page image
(EN)The present invention provides a novel four stage ab initio approach for predicting the tertiary structure of polypeptides. The methods of the invention combine the classical and modern views of protein folding, while using free energy calculations and integer linear optimization to predict helical and $g(b)-sheet structures. Derivation of restraints, detailed atomistic modeling, and a deterministic global optimization method, $g(a)BB, coupled with torsion angle dynamics, form the basis for the final tertiary structure prediction. The performance of the methods of the invention is illustrated using several different polypeptides.
(FR)La présente invention concerne une nouvelle approche de prédiction ab initio, en quatre étapes, de la structure tertiaire de polypeptides. Les procédés décrits dans cette invention consistent à combiner les vues classiques et contemporaines du repliement protéique, et à utiliser des calculs de l'énergie libre et l'optimisation linaire d'entiers relatifs pour prédire des structures de feuillets bêta et hélicoïdales. La dérivation de contraintes, la modélisation atomistique détaillée, et un processus d'optimisation global déterministe, alpha BB, couplés avec une dynamique d'angle de torsion, constituent la base pour la prédiction finale de la structure tertiaire. Le rendement des procédés décrits dans cette invention est illustré à l'aide de plusieurs polypeptides différents.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, OM, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZM, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)