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1. (WO2002046447) PROCEDE D'IDENTIFICATION DE NUCLEOTIDES A DES POSITIONS DETERMINES DANS DES ACIDES NUCLEIQUES CIBLES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2002/046447    N° de la demande internationale :    PCT/US2001/030742
Date de publication : 13.06.2002 Date de dépôt international : 01.10.2001
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 :    24.04.2002    
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : KECK GRADUATE INSTITUTE [US/US]; 535 Watson Drive, Claremont, CA 91711 (US) (Tous Sauf US).
VAN NESS, Jeffrey [US/US]; (US) (US Seulement).
GALAS, David, J. [US/US]; (US) (US Seulement).
GARRISON, Lori, K. [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : VAN NESS, Jeffrey; (US).
GALAS, David, J.; (US).
GARRISON, Lori, K.; (US)
Mandataire : PARKER, David, W.; Seed Intellectual Property Law Group PLLC, Suite 6300, 701 Fifth Avenue, Seattle, WA 98104-7092 (US)
Données relatives à la priorité :
60/237,409 02.10.2000 US
60/247,173 10.11.2000 US
60/247,172 10.11.2000 US
60/247,275 10.11.2000 US
60/247,166 10.11.2000 US
60/247,167 10.11.2000 US
60/263,971 24.01.2001 US
60/269,244 15.02.2001 US
60/300,319 21.06.2001 US
60/300,350 21.06.2001 US
60/301,394 27.06.2001 US
Titre (EN) METHODS FOR IDENTIFYING NUCLEOTIDES AT DEFINED POSITIONS IN TARGET NUCLEIC ACIDS
(FR) PROCEDE D'IDENTIFICATION DE NUCLEOTIDES A DES POSITIONS DETERMINES DANS DES ACIDES NUCLEIQUES CIBLES
Abrégé : front page image
(EN)The identity of a nucleotide of interest in a target nucleic acid molecule is determined by combining the target with two primers, where the first primer hybridizes to and extends from a location 3' of the nucleotide of interest in the target, so as to incorporate the complement of the nucleotide of interest in a first extension product. The second primer then hybridizes to and extends based on the first extension product, at a location 3' of the complement of the nucleotide of interest, so as to incorporate the nucleotide of interest in a second extension product. The first primer then hybridizes to and extends from a location 3' of the nucleotide of interest in the second extension product, so as to form, in combination with the second extension product, a nucleic acid fragment. The first and second primers are designed to incorporate a portion of the recognition sequence of a restriction endonuclease that recognizes a partially variable interrupted base sequence, $m(f)i$m(g)i.e.$m(f)/i$m(g), a sequence of the form A-B-C- where A and C are a number and sequence of bases essential for RE recognition, and B is a number of bases essential for RE recognition. The first primer incorporates the sequence A, the second primer incorporates the sequence C, and they are designed, in view of the target, to product a nucleic acid fragment where sequences A and C are separated by the bases B, where the nucleotide of interest is within region B. Action of the RE on the nucleic acid fragment provides a small nucleic acid fragment that is amendable to characterization, to thereby reveal the identity of the nucleotide of interest.
(FR)La présente invention concerne un procédé permettant de déterminer l'identité d'un nucléotide d'intérêt dans une molécule d'acide nucléique cible par la combinaison de la cible avec deux amorces, où la première amorce opère une hybridation à un emplacement 3' du nucléotide d'intérêt et s'étend à partir de celui-ci dans la cible, afin d'incorporer le complément du nucléotide d'intérêt dans un premier produit d'extension. La deuxième amorce opère ensuite une hybridation à un emplacement 3' du complément du nucléotide d'intérêt et s'étend en fonction du premier produit d'extension, afin d'incorporer le nucléotide d'intérêt dans un deuxième produit d'extension. Ensuite, la première amorce opère une hybridation à un emplacement 3' du nucléotide d'intérêt dans le deuxième produit d'extension et s'étend à partir de celui-ci, afin de constituer, en combinaison avec le deuxième produit d'extension, un fragment d'acide nucléique. Les première et deuxième amorces sont destinées à incorporer une portion de la séquence de reconnaissance d'une endonucléase de restriction qui reconnaît une séquence de base interrompu partiellement variable, c'est à dire, une séquence de formule A-B-C dans laquelle A et C sont un nombre et une séquence de bases essentielles à la reconnaissance RE, et B est un nombre de bases essentielles à la reconnaissance RE. La première amorce incorpore la séquence A, la deuxième amorce incorpore la séquence C, et elles sont destinées, par rapport à la cible, de produire un fragment d'acide nucléique où les séquences A et C sont séparées par les bases B, où le nucléotide d'intérêt se trouve au sein de la région B. L'action de la reconnaissance sur le fragment d'acide nucléique fournit un petit fragment d'acide nucléique qui peut faire l'objet d'une caractérisation, permettant ainsi de révéler l'identité du nucléotide d'intérêt.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, PH, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)