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1. (WO2002015106) PROCEDE ET SYSTEME POUR LA PREDICTION D'UNE STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE D'UNE PROTEINE DE TRANSMEMBRANE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication : WO/2002/015106 N° de la demande internationale : PCT/IL2001/000768
Date de publication : 21.02.2002 Date de dépôt international : 16.08.2001
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 : 14.03.2002
CIB :
G06F 19/16 (2011.01)
Déposants : BECKER, Oren, M.[IL/IL]; IL (UsOnly)
NAOR, Zvi[IL/IL]; IL (UsOnly)
SHACHAM, Sharon[IL/IL]; IL (UsOnly)
TOPF, Maya[IL/IL]; IL (UsOnly)
RAMOT UNIVERSITY AUTHORITY FOR APPLIED RESEARCH & INDUSTRIAL DEVELOPMENT LTD.[IL/IL]; Haim Levanon Street 32 69975 Tel Aviv, IL (AllExceptUS)
Inventeurs : BECKER, Oren, M.; IL
NAOR, Zvi; IL
SHACHAM, Sharon; IL
TOPF, Maya; IL
Mandataire : REINHOLD COHN AND PARTNERS; P.O. Box 4060 61040 Tel Aviv, IL
Données relatives à la priorité :
09/718,48824.11.2000US
13788516.08.2000IL
Titre (EN) PREDICTION METHOD OF A 3D STRUCTURE OF A TRANSMEMBRANE PROTEIN
(FR) PROCEDE ET SYSTEME POUR LA PREDICTION D'UNE STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE D'UNE PROTEINE DE TRANSMEMBRANE
Abrégé : front page image
(EN) The present invention relates to a method for predicting the three-dimensional (3D) structure of a multiple a-helical transmembrane (TM) protein or a portion thereof having multiple helical TM helices, whereby each helical region is represented as a (2D) dial, and the weighted hydrophobicity moment of each (2D) dial is calculated. Closed packing geometries are constructed in which the dials are ordered according to predetermined topologies. For each closed packing geometry, each dial is rotated around its axis so that the weighted hydrophobicity moment faces out from the packing geometry. Each rotated (2D) closed packing geometry is expanded into a corresponding reduced (3D) representation, and the reduced (3D) representation with the lowest total energy is determined. Further provided by the present invention is a computer based system, a computer program storage device readable by machine and a computer program product for the execution of the method of the invention.
(FR) Cette invention se rapporte à un procédé servant à prévoir la structure tridimensionnelle (3D) d'une protéine de transmembrane (TM) à multiples hélices $g(a) ou d'une partie de cette protéine, comportant des multiples hélices TM, de telle sorte que chaque région hélicoïdale est représentée par un disque en deux dimensions (2D) et le moment d'hydrophobicité pondérée de chaque disque 2D est calculé. On construit des géométries de tassement serré, dans lesquelles les disques sont classés en fonction de topologies prédéterminées. Pour chaque géométrie de tassement serré, on met en rotation chaque disque autour de son axe, pour que le moment d'hydrophobicité pondérée soit dirigé dans le sens opposé de la géométrie de tassement. Chaque géométrie de tassement serré 2D mise en rotation est déployée en une représentation 3D réduite correspondante, et la représentation 3D réduite ayant l'énergie totale la plus basse est déterminée. Cette invention concerne en outre un système informatique, un dispositif mémoire de programmes informatiques lisible par machine et un produit de programme informatique pour l'exécution de ce procédé.
États désignés : AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EC, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, MZ, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE, TR)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)