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1. (WO2001014587) PROCEDE DE DETECTION DANS UN ENVIRONNEMENT NATUREL ET DE QUANTIFICATION D'UN MICRO-ORGANISME A FONCTION SPECIFIQUE ET DE SON GENE, DONNEES SUR UN NOUVEAU GENE A ARN 16Sr ET NOUVELLES SONDES
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/2001/014587    N° de la demande internationale :    PCT/JP2000/005711
Date de publication : 01.03.2001 Date de dépôt international : 24.08.2000
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 :    24.08.2000    
CIB :
C12N 15/11 (2006.01), C12Q 1/04 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : NATIONAL INSTITUTE OF ADVANCED INDUSTRIAL SCIENCE AND TECHNOLOGY [JP/JP]; 3-1, Kasumigaseki 1-chome, Chiyoda-ku, Tokyo 100-8921 (JP) (Tous Sauf US).
NISHIMATSU CONSTRUCTION CO. LTD. [JP/JP]; 20-10, Toranomon 1-chome, Minato-ku, Tokyo 105-8401 (JP) (Tous Sauf US).
NYK LOGISTICS TECHNOLOGY INSTITUTE CO., LTD. [JP/JP]; Yusen Building 5th Floor, 3-2, Marunouchi 2-chome, Chiyoda-ku, Tokyo 100-0005 (JP) (Tous Sauf US).
MARUYAMA, Akihiko [JP/JP]; (JP) (US Seulement).
HIGASHIHARA, Takanori [JP/JP]; (JP) (US Seulement).
ISHIWATA, Hiroyuki [JP/JP]; (JP) (US Seulement).
FUJITA, Tsunemi [JP/JP]; (JP) (US Seulement)
Inventeurs : MARUYAMA, Akihiko; (JP).
HIGASHIHARA, Takanori; (JP).
ISHIWATA, Hiroyuki; (JP).
FUJITA, Tsunemi; (JP)
Mandataire : MAYAMA, Shinya; Mayama International Patent Office, Sakurai Building 4th Floor, 4-4, Chuorinkan 3-chome, Yamato-shi, Kanagawa 242-0007 (JP)
Données relatives à la priorité :
11/237818 25.08.1999 JP
Titre (EN) METHOD OF DETECTING AND QUANTITATING MICROORGANISM HAVING SPECIFIC FUNTION AND ITS GENE FROM NATURAL ENVIRONMENT, NOVEL 16SrRNA GENE DATA AND PROBES
(FR) PROCEDE DE DETECTION DANS UN ENVIRONNEMENT NATUREL ET DE QUANTIFICATION D'UN MICRO-ORGANISME A FONCTION SPECIFIQUE ET DE SON GENE, DONNEES SUR UN NOUVEAU GENE A ARN 16Sr ET NOUVELLES SONDES
Abrégé : front page image
(EN)A method of detecting and quantitating a microorganism having a specific function and its gene from natural environment which involves: 1) the step of estimating the priority of the microorganism having a specific function in the natural environment; 2) the step of amplifying specific gene domains of the microorganism having a specific function in a liquid culture medium of the highest dilution ratio at which the proliferation of the microorganism is judged as positive, followed by cloning; 3) examining the difference among the gene domains thus cloned and determining the base sequences thereof; and 4) identifying the microorganism having a specific function inhabiting in the natural environment from the base sequence data thus determined. 16SrDNAs having a base sequence represented by any of SEQ ID NOS:1 to 4. RNA or DNA probes of 10 to 50 bp in size which have a part of a base sequence represented by any of SEQ ID NOS:1 to 4 and are hybridizable specifically with a petroleum-digesting bacterium belonging to the genus Cycloclasticus.
(FR)L'invention porte sur un procédé de détection dans un environnement naturel et de quantification d'un micro-organismes à fonction spécifique et sur son gène, consistant à: (1) estimer la priorité d'un micro-organisme ayant une fonction spécifique dans l'environnement naturel; (2) amplifier certains domaines spécifiques dudit micro-organisme dans un milieu de culture présentant le plus fort rapport de dilution possible pour lequel la prolifération du micro-organisme est jugée positive, puis cloner; (3) examiner la différence entre les domaines ainsi clonés et déterminer leur séquence de base; et (4) identifier les micro-organismes à fonction spécifique présents dans l'environnement naturel à partir des données de la séquence de base ainsi déterminée. L'invention porte également sur les ADN 16Sr ayant une séquence de base représentée par l'une des SEQ ID NO 1à 4, et sur des sondes d'ARN et d'ADN d'une taille de 10 à 50 bp comportant une partie de l'une des séquences de base SEQ ID NO 1à 4 et étant spécifiquement hybridables avec une bactérie digérant le pétrole, de l'espèce Cycloclasticu.
États désignés : AU, CA, JP, US.
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE).
Langue de publication : japonais (JA)
Langue de dépôt : japonais (JA)