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1. WO2001002800 - METHODE ET SYSTEME D'IMAGERIE MULTIFONCTIONNEL D'ANALYSE CHROMOSOMIQUE EN FONCTION DES INFORMATIONS DE COULEUR ET DE REGION

Numéro de publication WO/2001/002800
Date de publication 11.01.2001
N° de la demande internationale PCT/EP2000/006138
Date du dépôt international 30.06.2000
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 18.01.2001
CIB
G01N 15/14 2006.01
GPHYSIQUE
01MÉTROLOGIE; TESTS
NRECHERCHE OU ANALYSE DES MATÉRIAUX PAR DÉTERMINATION DE LEURS PROPRIÉTÉS CHIMIQUES OU PHYSIQUES
15Recherche de caractéristiques de particules; Recherche de la perméabilité, du volume des pores ou de l'aire superficielle effective de matériaux poreux
10Recherche de particules individuelles
14Recherche par des moyens électro-optiques
G06K 9/00 2006.01
GPHYSIQUE
06CALCUL; COMPTAGE
KRECONNAISSANCE DES DONNÉES; PRÉSENTATION DES DONNÉES; SUPPORTS D'ENREGISTREMENT; MANIPULATION DES SUPPORTS D'ENREGISTREMENT
9Méthodes ou dispositions pour la lecture ou la reconnaissance de caractères imprimés ou écrits ou pour la reconnaissance de formes, p.ex. d'empreintes digitales
CPC
G01N 15/1475
GPHYSICS
01MEASURING; TESTING
NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
15Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume, or surface-area of porous materials
10Investigating individual particles
14Electro-optical investigation, e.g. flow cytometers
1468with spatial resolution of the texture or inner structure of the particle
1475using image analysis for extracting features of the particle
G06K 9/00127
GPHYSICS
06COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
KRECOGNITION OF DATA; PRESENTATION OF DATA; RECORD CARRIERS; HANDLING RECORD CARRIERS
9Methods or arrangements for reading or recognising printed or written characters or for recognising patterns, e.g. fingerprints
00127Acquiring and recognising microscopic objects, e.g. biological cells and cellular parts
Déposants
  • RUPRECHT-KARLS-UNIVERSITÄT HEIDELBERG [DE]/[DE] (AE, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BE, BF, BG, BJ, BR, BY, CA, CF, CG, CH, CI, CM, CN, CR, CU, CY, CZ, DE, DK, DM, EE, ES, FI, FR, GA, GB, GD, GE, GH, GM, GN, GR, GW, HR, HU, ID, IE, IL, IN, IS, IT, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MC, MD, MG, MK, ML, MN, MR, MW, MX, MZ, NE, NL, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, SN, SZ, TD, TG, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, UZ, VN, YU, ZA, ZW)
  • EILS, Roland [DE]/[DE] (UsOnly)
Inventeurs
  • EILS, Roland
Mandataires
  • VOSSIUS & PARTNER
Données relatives à la priorité
99112853.902.07.1999EP
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) METHOD AND MULTI-PURPOSE IMAGING SYSTEM FOR CHROMOSOMAL ANALYSIS BASED ON COLOR AND REGION INFORMATION
(FR) METHODE ET SYSTEME D'IMAGERIE MULTIFONCTIONNEL D'ANALYSE CHROMOSOMIQUE EN FONCTION DES INFORMATIONS DE COULEUR ET DE REGION
Abrégé
(EN)
The present invention relates to classification of chromosomes, and in particular to classification of multicolor images of combinatorially labeled probes. More particularly, the present invention relates to a multi-purpose imaging system for multicolor fluorescence in situ hybridization. The present invention provides a method and a system for automatically classifying chromosomes or portions thereof by combining color and region information. More particularly, the method comprises the steps of: selecting a first start pixel/voxel/region; selecting an adjacent pixel/voxel/region; determining dependent on a pre-selected similarity criteria whether said adjacent pixel/voxel/region is of similar direction; adding said adjacent pixel/voxel/region to said first pixel/voxel/region if said adjacent pixel/voxel/region is of similar direction so that a first region is grown; repeating steps b) to d) until no more adjacent pixels/voxels/regions are found that fulfil the selected similarity criteria; calculating a first color vector for said first grown region; repeating steps a) to f) with further start pixels to grow further regions until no more regions can be grown; and performing clasification on the weighted region color vectors.
(FR)
La présente invention concerne la classification des chromosomes et en particulier la classification d'images multicolores de sondes marquées de manière combinatoire. L'invention concerne plus particulièrement un système d'imagerie multifonctionnel destiné à l'hybridation in situ en fluorescence multicolore. L'invention concerne un procédé et un système de classement automatique de chromosomes, ou de parties de chromosomes, qui combine des informations de couleur et de région. Le procédé consiste notamment à sélectionner un premier pixel/voxel/région de départ ; à sélectionner un pixel/voxel/région adjacent ; à déterminer en fonction d'un critère de similarité préalablement sélectionné si le pixel/voxel/région adjacent présente une orientation similaire ; à ajouter ledit pixel/voxel/région adjacent au premier pixel/voxel/région s'il présente une orientation similaire de manière à faire croître une première région ; à répéter les étapes b) à d) jusqu'à ce qu'on ne trouve plus de pixels/voxels/régions adjacents remplissant les critères de similarité sélectionnés ; à calculer un premier vecteur de couleur pour ladite première région constituée ; à répéter les étapes a) à f) avec d'autres pixels de départ afin de constituer d'autres régions, jusqu'à ce qu'on ne puisse plus en constituer ; et à effectuer un classement selon les vecteurs de couleur des régions pondérés.
Également publié en tant que
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