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1. (WO1999035256) CRIBLAGE DE MOLECULES INTERACTIVES VIA DES SERIES D'OLIGONUCLEOTIDES OU DE POLYNUCLEOTIDES AU NIVEAU DU GENOME COMPLET
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international   

N° de publication :    WO/1999/035256    N° de la demande internationale :    PCT/IB1999/000048
Date de publication : 15.07.1999 Date de dépôt international : 06.01.1999
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 :    02.08.1999    
CIB :
C12N 15/10 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Déposants : INSTITUT PASTEUR [FR/FR]; 28, rue du Docteur Roux, F-75015 Paris (FR) (Tous Sauf US).
STANFORD UNIVERSITY [US/US]; Office of Technology Licensing, Suite 350, 900 Welch Road, Palo Alto, CA 94304-1850 (US) (Tous Sauf US).
AFFYMETRIX [US/US]; 3380 Central Expressway, Santa Clara, CA 95051 (US) (Tous Sauf US).
LEGRAIN, Pierre [FR/FR]; (FR) (US Seulement).
FROMONT-RACINE, Micheline [FR/FR]; (FR) (US Seulement).
CHO, Raymond [US/US]; (US) (US Seulement).
DAVIS, Ronald [US/US]; (US) (US Seulement).
LOCKHART, D. [US/US]; (US) (US Seulement).
WODICKA, L. [US/US]; (US) (US Seulement)
Inventeurs : LEGRAIN, Pierre; (FR).
FROMONT-RACINE, Micheline; (FR).
CHO, Raymond; (US).
DAVIS, Ronald; (US).
LOCKHART, D.; (US).
WODICKA, L.; (US)
Mandataire : MARTIN, Jean-Jacques; Cabinet Regimbeau, 26, avenue Kléber, F-75116 Paris (FR)
Données relatives à la priorité :
09/003,335 06.01.1998 US
09/154,972 17.09.1998 US
Titre (EN) SCREENING INTERACTOR MOLECULES WITH WHOLE GENOME OLIGONUCLEOTIDE OR POLYNUCLEOTIDE ARRAYS
(FR) CRIBLAGE DE MOLECULES INTERACTIVES VIA DES SERIES D'OLIGONUCLEOTIDES OU DE POLYNUCLEOTIDES AU NIVEAU DU GENOME COMPLET
Abrégé : front page image
(EN)This invention relates to methods for the identification of nucleic acids by direct hybridization to high-density oligonucleotide arrays. The methods of this invention comprise the steps of: (a) screening a DNA library, such as an $i(S. cerevisiae) genomic DNA library, by performing a double hybrid screening method with a recombinant vector containing a DNA insert encoding a candidate protein of interest and then selecting the clones from the DNA library that code for proteins that interact with the candidate protein of interest; and (b) hybridizing the DNA inserts contained in the clones that have been selected in step (a) using an oligonucleotide probe matrix wherein the probe locations on the host genome cover all of the coding sequences, determining the hybridization location and consequently, the gene coding for a specific protein that interacts with the candidate protein of interest in the double hybrid screening system. This invention is also directed to the polynucleotides obtained by the methods of this invention, the polypeptides encoded by those polynucleotides and the DNA arrays utilized in the methods of this invention.
(FR)L'invention concerne des procédés permettant l'identification d'acides nucléiques par hybridation directe sur des séries d'oligonucléotides à haute densité. Les procédés considérés comprennent les étapes suivantes: (a) criblage d'une bibliothèque d'ADN, du type bibliothèque d'ADN génomique de $i(S. cerevisiae), via un système de criblage à double hybride reposant sur un vecteur de recombinaison dans lequel on a introduit un fragment d'ADN codant une protéine candidate recherchée, puis sélection des clones de la bibliothèque d'ADN qui codent les protéines capables d'interaction avec ladite protéine candidate; et (b) hybridation des fragments d'ADN introduits dans les clones sélectionnés au titre de l'étape (a) via une matrice à sonde oligonucléotidique, sachant que les emplacements de sonde sur le génome hôte couvrent l'ensemble des séquences de codage, puis détermination du point d'hybridation et, partant, du gène de codage pour une protéine spécifique capable d'interaction avec la protéine candidate recherchée dans le système de criblage à double hybride. L'invention concerne en outre les polynucléotides obtenus au moyen des procédés décrits, ainsi que les polypeptides codés par ces polynucléotides et les séries d'ADN utilisées aux fins desdits procédés.
États désignés : AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA, CH, CN, CU, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZW.
Organisation régionale africaine de la propriété intellectuelle (ARIPO) (GH, GM, KE, LS, MW, SD, SZ, UG, ZW)
Office eurasien des brevets (OEAB) (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE)
Organisation africaine de la propriété intellectuelle (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Langue de publication : anglais (EN)
Langue de dépôt : anglais (EN)