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1. WO1997021835 - MARQUEURS D'ADN POUR LA SELECTION DES CREVETTES

Numéro de publication WO/1997/021835
Date de publication 19.06.1997
N° de la demande internationale PCT/US1996/019568
Date du dépôt international 12.12.1996
CIB
C12Q 1/68 2006.01
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
C12Q 1/6888
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6888for detection or identification of organisms
C12Q 2600/156
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
156Polymorphic or mutational markers
Déposants
  • WORCESTER POLYTECHNIC INSTITUTE [US]/[US]
Inventeurs
  • BAGSHAW, Joseph, C.
  • BUCKHOLT, Michael, A.
Mandataires
  • PABST, Patrea, L.
Données relatives à la priorité
08/570,75112.12.1995US
Langue de publication anglais (EN)
Langue de dépôt anglais (EN)
États désignés
Titre
(EN) DNA MARKERS FOR SHRIMP SELECTION
(FR) MARQUEURS D'ADN POUR LA SELECTION DES CREVETTES
Abrégé
(EN)
Isolated DNA from $i(Penaeus vannamei) was digested with restriction enzymes, restriction fragments of genomic DNA inserted into a plasmid vector and screened for recombinant plasmids containing repeated sequences. Ten of the resulting isolates contained representatives of the same repeated element, a satellite sequence present in one or more blocks of tandemly repeated units. The cloned repeat units range in size from about 100 to 200 base pairs, more typically between about 139 to 188 base pairs. Embedded within each cloned repeat unit are 6 to 15 copies of a tandemly repeated pentanucleotide microsatellite. The genome of $i(P. vannamei) contains approximately one million copies of this satellite/microsatellite unit. The sequences are useful as markers for the selection of shrimp having a genetically-transmitted favorable growth characteristic, such as increased reproduction, enhanced growth rate, increased size, disease-resistance, and the ability to grow in colder waters, for improved aquacultured shrimp production. Hybridization of the marker to an isolated $i(Peaneus) shrimp mucleic acid molecule can be used to identify species, strains or individual shrimp having the desired characteristics. Once identified, these shrimps can be bred to shrimp having the same or an additional desired characteristic to produce a high quality, genetically superior seedstock or larvae useful for the economic production of farmed shrimp.
(FR)
L'invention concerne un processus qui comprend les opérations suivantes: isolation d'ADN dans l'espèce des crevettes $i(Penaeus vannamei), digestion de cet ADN au moyen d'enzymes de restriction, insertion des fragments de restriction d'ADN génomique dans un vecteur plasmide et sélection de plasmides hybrides contenant des séquences répétitives. On a constaté que, dans dix des isolats résultants, apparaissaient les représentants du même élément répétitif, à savoir une séquence satellite présente dans un ou plusieurs blocs d'unités répétées en tandem. Les unités de répétition clonées ont une taille comprise environ entre 100 et 200 paires de bases, et aussi en plus généralement entre 139 et 188 paires de bases. Entre 6 et 15 copies d'un microsatellite de pentanucléotide à répétition en tandem sont incorporées dans chaque unité de répétition clonée. Le génome de $i (P. vannemei) contient environ un million de copies de cette unité satellite/microsatellite. Les séquences sont utiles en tant que marqueurs pour la sélection de crevettes présentant des caractéristiques de croissance favorables inhérentes à la transmission génétique (par exemple, reproduction accrue, taux de développement amélioré, taille plus élevée, résistance aux maladies et croissance avérée dans les eaux froides pour améliorer la production des crevettes d'élevage). L'hybridation du marqueur avec une molécule d'acide nucléique isolée chez la crevette de type $i(Penaeus) peut être utilisée pour l'identification d'espèces, de souches ou de crevettes individuelles ayant les caractéristiques voulues. Une fois identifiées, ces crevettes peuvent développer en élevage des caractéristiques identiques ou bien telle ou telle propriété supplémentaire recherchée en vue d'obtenir des oeufs ou des larves de haute qualité à potentiel génétique supérieur dont l'utilisation est avantageuse pour la production économique des crevettes en élevage.
Également publié en tant que
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