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1. (WO1993018186) HYBRIDATION GENOMIQUE COMPARATIVE
Dernières données bibliographiques dont dispose le Bureau international

N° de publication : WO/1993/018186 N° de la demande internationale : PCT/US1993/001775
Date de publication : 16.09.1993 Date de dépôt international : 01.03.1993
Demande présentée en vertu du Chapitre 2 : 30.09.1993
CIB :
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHIMIE; MÉTALLURGIE
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BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
Q
PROCÉDÉS DE MESURE, DE RECHERCHE OU D'ANALYSE FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
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Procédés de mesure, de recherche ou d'analyse faisant intervenir des enzymes ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
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faisant intervenir des acides nucléiques
Déposants :
THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA [US/US]; 300 Lakeside Drive, 22nd Floor Oakland, CA 94612-3565, US
Inventeurs :
PINKEL, Daniel; US
GRAY, Joe, W.; US
KALLIONIEMI, Anne; FI
KALLIONIEMI, Olli, Pekka; FI
WALDMAN, Frederic; US
Mandataire :
HUNTINGTON, R., Danny,; Burns, Doane, Swecker & Mathis George Mason Building Washington & Prince Streets Post Office Box 1404 Alexandria, VA 22313-1404, US
Données relatives à la priorité :
07/846,65904.03.1992US
07/969,94830.10.1992US
Titre (EN) COMPARATIVE GENOMIC HYBRIDIZATION (CGH)
(FR) HYBRIDATION GENOMIQUE COMPARATIVE
Abrégé :
(EN) Disclosed are new methods comprising the use of $i(in situ) hybridization to detect abnormal nucleic acid sequence copy numbers in one or more genomes wherein repetitive sequences that bind to multiple loci in a reference chromosome spred are either substantially removed and/or their hybridization signals suppressed. The invention termed Comparative Genomic Hybridization (CGH) provides for methods of determining the relative number of copies of nucleic acid sequences in one or more subject genomes or portions thereof (for example, a tumor cell) as a function of the location of those sequences in a reference genome (for example, a normal human genome). The intensity(ies) of the signals from each labeled subject nucleic acid and/or the differences in the ratios between different signals from the labeled subject nucleic acid sequences are compared to determine the relative copy numbers of the nucleic acid sequences in the one or more subject genomes as a function of position along the reference chromosome spread. Amplifications, duplications and/or deletions in the subject genome(s) can be detected. Also provided is a method of determining the absolute copy numbers of substantially all RNA or DNA sequences in subject cell(s) or cell population(s).
(FR) L'invention concerne de nouveaux procédés consistant à pratiquer l'hybridation $i(in situ) afin de détecter des quantités de copies de séquences d'acide nucléique anormales dans au moins un génome. Les séquences répétitives se lient aux locus multiples d'une propagation chromosomique de référence et sont retirées totalement et/ou amputées de leurs signaux d'hybridation. L'invention appelée hybridation génomique comparative (HGC) concerne des procédés de détermination du nombre relatif de copies de séquences d'acide nucléique dans au moins un desdits génomes ou une des parties de ceux-ci (par exemple, une cellule tumorale) en tant que fonction de la localisation de ces séquences dans un génome de référence (par exemple, un génome humain normal). L'intensités ou les intensités des signaux de chaque acide nucléique marqué et/ou les différences de rapports entre les signaux différents provenant desdites séquences d'acide nucléique marquées sont comparées pour déterminer les quantités relatives de copies des séquences d'acide nucléique dans un ou plusieurs génomes en tant que fonction de la position le long de la propagation chromosomique de référence. Des amplifications, des duplications et/ou des délétions du (des) génome(s) concerné(s) peuvent être détectées. L'invention concerne un procédé de détermination des quantités de copies absolues de toutes les séquences d'ARN ou d'ADN de la (des) cellule(s) concernée(s) ou de la (des) population(s) cellulaire(s).
États désignés : AU, CA, JP, KR
Office européen des brevets (OEB) (AT, BE, CH, DE, DK, ES, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE)
Langue de publication : Anglais (EN)
Langue de dépôt : Anglais (EN)
Également publié sous:
EP0631635JPH07505053CA2131543AU1993037808