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1. US20060090217 - Isolation of proteins involved in posttranscriptional gene silencing and methods of use

Office
États-Unis d'Amérique
Numéro de la demande 11252080
Date de la demande 17.10.2005
Numéro de publication 20060090217
Date de publication 27.04.2006
Type de publication A1
CIB
A01H 1/00
ANÉCESSITÉS COURANTES DE LA VIE
01AGRICULTURE; SYLVICULTURE; ÉLEVAGE; CHASSE; PIÉGEAGE; PÊCHE
HNOUVEAUTÉS VÉGÉTALES OU PROCÉDÉS POUR LEUR OBTENTION; REPRODUCTION DE PLANTES PAR DES TECHNIQUES DE CULTURE DE TISSUS
1Procédés de modification des génotypes
C12N 9/22
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
9Enzymes, p.ex. ligases (6.); Proenzymes; Compositions les contenant; Procédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
14Hydrolases (3.)
16agissant sur les liaisons esters (3.1)
22Ribonucléases
C12N 15/29
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
11Fragments d'ADN ou d'ARN; Leurs formes modifiées
29Gènes codant pour des protéines végétales, p.ex. thaumatine
C12N 15/82
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
63Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteurs; Vecteurs; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci; Régulation de l'expression
79Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
82pour cellules végétales
C40B 30/06
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
40TECHNOLOGIE COMBINATOIRE
BCHIMIE COMBINATOIRE; BIBLIOTHÈQUES, p.ex. CHIMIOTHÈQUES, BIBLIOTHÈQUES VIRTUELLES (IN SILICO)
30Procédés de criblage des bibliothèques
06en mesurant les effets sur des cellules, des tissus ou des organismes vivants
Déposants MIRKOV T E
INGELBRECHT IVAN L
Inventeurs Mirkov T. Erik
Ingelbrecht Ivan L.
Mandataires BAKER BOTTS L.L.P.
Données relatives à la priorité 10226715 23.08.2002 US
11252080 17.10.2005 US
60314863 24.08.2001 US
Titre
(EN) Isolation of proteins involved in posttranscriptional gene silencing and methods of use
Abrégé
(EN)

The present invention includes a method for detecting and isolating sugarcane proteins that interact with the HC-Pro and P1 proteins of SrMV and other proteins involved in gene silencing, particularly in sugarcane. The method uses a two hybrid assay with an HC-Pro, P1, or other silencing-related protein-containing bait protein and a prey protein containing a polypeptide encoded by a DNA molecule in a cDNA library. The method also includes identification of false positives through reverse two-hybrid assays and using in vitro techniques such as farwestern blots or pull down assays where plant physiological conditions may be replicated. Finally, interactions may be confirmed in planta. Some novel proteins used in and discovered using the these methods are also identified. Methods of using viral and plant proteins to regulate silencing in plants such as sugarcane are also discussed.