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1. EP2975123 - DISPOSITIF À RÉSEAU CELLULAIRE BIDIMENSIONNEL ET APPAREIL POUR LA QUANTIFICATION DE GÈNES ET L'ANALYSE DE SÉQUENCES

Office
Office européen des brevets (OEB)
Numéro de la demande 13878277
Date de la demande 12.03.2013
Numéro de publication 2975123
Date de publication 20.01.2016
Type de publication B1
CIB
C12N 15/10
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
NMICRO-ORGANISMES OU ENZYMES; COMPOSITIONS LES CONTENANT; CULTURE OU CONSERVATION DE MICRO-ORGANISMES; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE; MILIEUX DE CULTURE
15Techniques de mutation ou génie génétique; ADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p.ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purification; Utilisation d'hôtes pour ceux-ci
09Technologie d'ADN recombinant
10Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12M 1/00
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
MAPPAREILLAGE POUR L'ENZYMOLOGIE OU LA MICROBIOLOGIE
1Appareillage pour l'enzymologie ou la microbiologie
C12Q 1/68
CCHIMIE; MÉTALLURGIE
12BIOCHIMIE; BIÈRE; SPIRITUEUX; VIN; VINAIGRE; MICROBIOLOGIE; ENZYMOLOGIE; TECHNIQUES DE MUTATION OU DE GÉNÉTIQUE
QPROCÉDÉS DE MESURE OU DE TEST FAISANT INTERVENIR DES ENZYMES, DES ACIDES NUCLÉIQUES OU DES MICRO-ORGANISMES; COMPOSITIONS OU PAPIERS RÉACTIFS À CET EFFET; PROCÉDÉS POUR PRÉPARER CES COMPOSITIONS; PROCÉDÉS DE COMMANDE SENSIBLES AUX CONDITIONS DU MILIEU DANS LES PROCÉDÉS MICROBIOLOGIQUES OU ENZYMOLOGIQUES
1Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismes; Compositions à cet effet; Procédés pour préparer ces compositions
68faisant intervenir des acides nucléiques
CPC
C12N 15/1003
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
1003Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
B01L 3/502761
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
3Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware
50Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
502with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
5027by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
502761specially adapted for handling suspended solids or molecules independently from the bulk fluid flow, e.g. for trapping or sorting beads, for physically stretching molecules
B01L 7/52
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
7Heating or cooling apparatus
52with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
B01L 2200/0631
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2200Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
06Fluid handling related problems
0631Purification arrangements, e.g. solid phase extraction [SPE]
B01L 2200/0668
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2200Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
06Fluid handling related problems
0647Handling flowable solids, e.g. microscopic beads, cells, particles
0668Trapping microscopic beads
B01L 2200/10
BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
LCHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
2200Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
10Integrating sample preparation and analysis in single entity, e.g. lab-on-a-chip concept
Déposants HITACHI LTD
Inventeurs SHIRAI MASATAKA
KAMBARA HIDEKI
TANIGUCHI KIYOMI
TANABE MAIKO
États désignés
Titre
(DE) ZWEIDIMENSIONALE ZELLENMATRIXVORRICHTUNG UND VORRICHTUNG ZUR GENQUANTIFIZIERUNG UND SEQUENZANALYSE
(EN) TWO-DIMENSIONAL CELL ARRAY DEVICE AND APPARATUS FOR GENE QUANTIFICATION AND SEQUENCE ANALYSIS
(FR) DISPOSITIF À RÉSEAU CELLULAIRE BIDIMENSIONNEL ET APPAREIL POUR LA QUANTIFICATION DE GÈNES ET L'ANALYSE DE SÉQUENCES
Abrégé
(EN)
In order to conduct gene expression analysis of a number of genes in a number of cells, it has been necessary to separate cells, extract genes therefrom, amplify nucleic acids, and perform sequence analysis. However, separation of cells imposes damages on the cells, and it requires the use of an expensive system. Gene expression analysis in each cell can be carried out with high accuracy by arranging a pair of structures comprising a cell trapping section and a nucleic acid trapping section in a vertical direction to extract individual genes in relevant cells, synthesizing cDNA in the nucleic acid trapping section, amplifying nucleic acids, and analyzing the sequences using a next-generation sequencer.

(FR)
L'invention concerne un dispositif à réseau cellulaire bidimensionnel et un appareil pour la quantification de gènes et l'analyse de séquences. Pour exprimer un certain nombre de gènes dans un certain nombre de cellules, il est nécessaire de séparer les cellules, d'en extraire les gènes, puis d'amplifier les acides nucléiques, et d'analyser l'expression des gènes par analyse de séquences. La séparation des cellules endommage toutefois sérieusement les cellules et nécessite un système coûteux. Selon la présente invention, l'expression de gènes dans des cellules individuelles est analysée de manière hautement précise par : agencement d'une paire de structures comprenant une section de piégeage de cellules et une section de piégeage d'acides nucléiques dans une direction verticale pour extraire des gènes individuels dans les cellules ; synthèse d'ADNc dans la section de piégeage d'acides nucléiques ; amplification des acides nucléiques ; puis analyse de leurs séquences avec un séquenceur de nouvelle génération.