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1. (WO2019031867) METHOD FOR INCREASING ACCURACY OF ANALYSIS BY REMOVING PRIMER SEQUENCE IN AMPLICON-BASED NEXT-GENERATION SEQUENCING
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Nº de publicación: WO/2019/031867 Nº de la solicitud internacional: PCT/KR2018/009088
Fecha de publicación: 14.02.2019 Fecha de presentación de la solicitud internacional: 09.08.2018
CIP:
G06F 19/24 (2011.01) ,G06F 19/20 (2011.01)
G FISICA
06
COMPUTO; CALCULO; CONTEO
F
TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS
19
Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas
10
Bioinformática, p.ej. métodos o sistemas para el procesamiento de datos relacionados con la genética o las proteínas en biología molecular computacional
24
para aprendizaje automático, minería de datos o bioestadística, p.ej. identificación de patrones, descubrimiento de conocimiento, extracción de reglas, correlación, agrupamiento o clasificación.
G FISICA
06
COMPUTO; CALCULO; CONTEO
F
TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS
19
Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas
10
Bioinformática, p.ej. métodos o sistemas para el procesamiento de datos relacionados con la genética o las proteínas en biología molecular computacional
20
para hibridación o expresión génica, p.ej. microarrays, secuenciación por hibridación, normalización, perfiles, modelos de corrección de ruido, estimación de la ratio de expresión, diseño de sondas u optimización de sondas.
Solicitantes:
주식회사 엔젠바이오 NGENEBIO [KR/KR]; 서울시 구로구 디지털로 242 909호, 1010호, 1104호, 1105호 No.909, No.1010, No.1104, No.1105 242, Digital-ro Guro-gu Seoul 08394, KR
Personas inventoras:
이창선 LEE, Chang Seon; KR
홍창범 HONG, Chang Bum; KR
오은설 OH, Ensel; KR
김광중 KIM, Kwang Joong; KR
Mandataria/o:
이처영 LEE, Cheo Young; KR
장제환 CHANG, Je Hwan; KR
Datos de prioridad:
10-2017-010154010.08.2017KR
Título (EN) METHOD FOR INCREASING ACCURACY OF ANALYSIS BY REMOVING PRIMER SEQUENCE IN AMPLICON-BASED NEXT-GENERATION SEQUENCING
(FR) PROCÉDÉ D'AUGMENTATION DE LA PRÉCISION D'ANALYSE PAR ÉLIMINATION D'UNE SÉQUENCE D'AMORCE DANS UN SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION, BASÉ SUR UN AMPLICON
(KO) 앰플리콘 기반 차세대 염기서열 분석기법에서 프라이머 서열을 제거하여 분석의 정확도를 높이는 방법
Resumen:
(EN) The present invention relates to a method for increasing the efficiency of read data analysis by removing primer sequence information present in a read obtained through next-generation sequencing (NGS) and, more specifically, to a method for matching information of a read and a designed primer to various reference values in several steps so as to determine primer sequence information within a read, and then precisely removing only a primer sequence so as to increase the efficiency of read data analysis. The method for increasing the efficiency of read data analysis in a primer removal-based NGS, according to the present invention, has a rapid data analysis speed and can precisely remove only a primer sequence, thereby being useful for increasing the efficiency and accuracy of read data analysis.
(FR) La présente invention concerne un procédé d'augmentation de l'efficacité d'analyse de données de lecture par élimination d'informations de séquence d'amorce présentes dans une lecture obtenue par un séquençage de nouvelle génération (NGS) et, plus spécifiquement, un procédé de mise en correspondance d'informations d'une amorce lue et d'une amorce conçue à diverses valeurs de référence en plusieurs étapes, de manière à déterminer des informations de séquence d'amorce dans une lecture, puis à retirer précisément une seule séquence d'amorce, de façon à augmenter l'efficacité de l'analyse de données de lecture. Selon la présente invention, le procédé d'augmentation de l'efficacité d'analyse de données de lecture dans un NGS basé sur un retrait d'amorce a une vitesse rapide d'analyse de données et peut éliminer précisément une seule séquence d'amorce, ce qui est utile pour augmenter l'efficacité et la précision d'analyse de données de lecture.
(KO) 본 발명은 NGS를 통해 수득하는 리드에 존재하는 프라이머 서열 정보를 제거하여 리드 데이터 분석의 효율을 증가시키는 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 리드와 설계한 프라이머 정보를 여러 단계에 걸쳐 다양한 기준값으로 매칭하여 리드내 프라이머 서열 정보를 결정한 다음, 프라이머 서열만 정확하게 제거하여 리드 데이터 분석의 효율을 증가시키는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 프라이머 제거 기반 차세대 염기서열 분석기법(Next Generation Sequencing, NGS)에서 리드 데이터 분석 효율 증가 방법은, 데이터 분석의 속도가 빠르고, 민프라이머 서열만 정확하게 제거할 수 있어, 리드 데이터 분석의 효율 및 정확도를 증가시키는데 유용하다.
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African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Oficina Eurasiática de Patentes (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
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Organización Africana de la Propiedad Intelectual (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Idioma de publicación: Coreano (KO)
Idioma de la solicitud: Coreano (KO)