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1. (WO2015026219) MÉTODO PARA LA DETECCIÓN MÚLTIPLE DE VIRUS DE INFLUENZA TIPO A, TIPO B, O TIPO C MEDIANTE OLIGONUCLEÓTIDOS DISEÑADOS PARA PERMITIR DISCRIMINACIÓN ALÉLICA EN UNA REACCIÓN DE RT-PCR MULTIPLEX
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Nº de publicación:    WO/2015/026219    Nº de la solicitud internacional:    PCT/MX2014/000129
Fecha de publicación: 26.02.2015 Fecha de presentación de la solicitud internacional: 14.08.2014
CIP:
C12Q 1/68 (2006.01)
Solicitantes: UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE NUEVO LEÓN [MX/MX]; Av. Pedro de Alba S/N, Torre de Rectoría Ciudad Universitaria San Nicolás de los Garza, Nuevo León 66451 (MX)
Personas inventoras: VELASCO CASTAÑON, José Gerardo; (MX).
LEDESMA GUADARRAMA, Omar Martín; (MX)
Mandataria/o: GÓMEZ FLORES, Ricardo Alberto; (MX)
Datos de prioridad:
MX/a/2013/009755 23.08.2013 MX
Título (EN) METHOD FOR THE MULTIPLE DETECTION OF INFLUENZA VIRUS TYPE A, TYPE B OR TYPE C BY MEANS OF OLIGONUCLEOTIDES DESIGNED TO ALLOW ALLELIC DISCRIMINATION IN A MULTIPLEX RT-PCR
(ES) MÉTODO PARA LA DETECCIÓN MÚLTIPLE DE VIRUS DE INFLUENZA TIPO A, TIPO B, O TIPO C MEDIANTE OLIGONUCLEÓTIDOS DISEÑADOS PARA PERMITIR DISCRIMINACIÓN ALÉLICA EN UNA REACCIÓN DE RT-PCR MULTIPLEX
(FR) MÉTHODE DE DÉTECTION MULTIPLE DU VIRUS DE LA GRIPPE DE TYPE A, B, OU C AU MOYEN D'OLIGONUCLÉOTIDES ÉLABORÉS POUR PERMETTRE LA DISCRIMINATION ALLÉLIQUE DANS UNE RÉACTION DE MULTIPLEX RT-PCR
Resumen: front page image
(EN)The invention relates to a broad-spectrum detection system having a specificity of 99% and being based on mechanisms for the multiple allelic differentiation of influenza virus type A (sub-types H1N1, H3N2, H5N1, H7N3), type B or type C. The main components of the system are sense oligonucleotides that allow allelic discrimination, said oligonucleotides exhibiting varous characteristics including: a modification in the penultimate nucleotide of region 3' in order to generate a mismatch when hybridising to the target sequence of the M1 gene; the corresponding polymorphism of the sequence to be analysed being located in the last nucleotide of region 3'; and said oligonucleotides being specific for highly conserved regions having a low incidence of genetic drift. The system also comprises antisense oligonucleotides designed such that they are specific for non-conserved regions in order to guarantee their specificity for the specific region of the target sequence to be analysed. All the aforementioned forms part of one single reaction allowing the multiple differential analysis of the different types and sub-types of influenza, and leading to a reduction in the time it takes to obtain results and an increase in the viability thereof for use in epidemiological population studies.
(ES)La presente invención presenta un sistema de detección de amplio espectro, con una especificidad del 99% y basado en mecanismos de diferenciación alélica múltiple del virus de influenza tipo A (subtipos H1 N1, H3N2, H5N1, H7N3), tipo B o tipo C. Los componentes principales del sistema son: oligonucleótidos sentido que permiten la discriminación alélica, dichos oligonucleótidos presentan diversas características entre las que se encuentran: a) una modificación en el penúltimo nucleótido de la región 3' para de este modo generar un mismatch al momento de hibridar con la secuencia blanco del gen M1, b) el polimorfismo correspondiente de la secuencia a analizar se coloca en el último nucleótido de la región 3' y c) son específicos por regiones altamente conservadas las cuales tienen poca incidencia de deriva genética. Por otra parte se encuentran los oligonucleótidos antisentido que son diseñados de modo que sean específicos por regiones no conservadas para garantizar su especificidad por la región específica de la secuencia blanco a analizar. Todo lo mencionado anteriormente es parte de una misma reacción lo que posibilita el análisis múltiple diferencial de los diferentes tipos y subtipos de influenza, y trae consigo una reducción del tiempo para la obtención de resultados y un aumento de su viabilidad para su uso en estudios epidemiológicos poblacionales.
(FR)La présente invention concerne un système de détection à large spectre, ayant une spécificité de 99% et reposant sur des mécanismes de différenciation allélique multiple du virus de la grippe de type A (sous-types H1 N1, H3N2, H5N1, H7N3), de type B ou de type C. Les principaux composants du système sont des oligonucléotides sens qui permettent la discrimination allélique et présentent diverses caractéristiques parmi lesquelles on compte a) une modification de l'avant dernier nucléotide de la région 3' pour générer ainsi un mésappariement au moment de l'hybridation avec la séquence cible du gène M1, b) le polymorphisme correspondant de la séquence à analyser se trouvant dans le dernier nucléotide de la région 3' et c) leur spécificité pour des régions hautement conservées qui ont peu d'incidence de dérive génétique. Par ailleurs, l'invention concerne les oligonucléotides antisens qui sont élaborés de manière à être spécifiques de régions non conservées pour garantir leur spécificité par la région spécifique de la séquence cible à analyser. Tout ce qui a été décrit antérieurement fait partie d'une même réaction, ce qui rend possible l'analyse multiple différentielle des différents types et sous-types de grippe et entraîne conjointement une diminution du temps d'obtention de résultats et une augmentation de leur viabilité pour leur utilisation dans des études épidémiologiques des populations.
Estados designados: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
Organización Regional Africana de la Propiedad Intelectual (ORAPI) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Organización Eurasiática de Patentes (OEAP) (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
Oficina Europea de Patentes (OEP) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
Organización Africana de la Propiedad Intelectual (OAPI) (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Idioma de publicación: español (ES)
Idioma de la solicitud: español (ES)