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1. WO2022002958 - DETECTION OF METHYLATION STATUS

Publication Number WO/2022/002958
Publication Date 06.01.2022
International Application No. PCT/EP2021/067880
International Filing Date 29.06.2021
IPC
C12Q 1/6832 2018.1
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
6813Hybridisation assays
6832Enhancement of hybridisation reaction
Applicants
  • PENTABASE APS [DK]/[DK]
Inventors
  • BENDIXEN, Kamilla Kolding
  • PETERSEN, Rasmus Koefoed
  • CHRISTENSEN, Ulf Bech
Agents
  • HØIBERG P/S
Priority Data
20182947.029.06.2020EP
Publication Language English (en)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) DETECTION OF METHYLATION STATUS
(FR) DÉTECTION D'ÉTATS DE MÉTHYLATION
Abstract
(EN) The present invention relates to a method for determining epigenetic modification status of at least one nucleotide of interest (NOI) in a target nucleic acid sequence of interest. The invention is based on the finding that certain oligonucleotides comprising hydrophobic nucleotides have significant differences in melting temperature to epigenetically modified target nucleic acids compared to unmodified target nucleic acids. The methods have multiple applications for example in diagnosis. The invention also provides oligonucleotides, in particular BasePrimers for use in such methods.
(FR) La présente invention concerne un procédé de détermination de l'état de modification épigénétique d'au moins un nucléotide d'intérêt (abrégé NOI de l'anglais « nucleotide of interest ») dans une séquence d'acide nucléique cible d'intérêt. L'invention est basée sur la découverte que certains oligonucléotides comprenant des nucléotides hydrophobes ont des différences significatives de température de fusion à des acides nucléiques cibles génétiquement modifiés par comparaison avec des acides nucléiques cibles non modifiés. Les procédés ont de multiples applications, par exemple, dans le diagnostic. L’invention concerne également des oligonucléotides, en particulier des amorces de base à utiliser dans de tels procédés.
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