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1. WO2020206184 - METHODS, SYSTEMS, AND APARATUS FOR NUCLEIC ACID DETECTION

Publication Number WO/2020/206184
Publication Date 08.10.2020
International Application No. PCT/US2020/026480
International Filing Date 02.04.2020
IPC
C12N 15/10 2006.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09Recombinant DNA-technology
10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
C12Q 1/16886
Applicants
  • MISSION BIO, INC. [US]/[US]
Inventors
  • DHINGRA, Dalia
  • RUFF, David
  • MENDEZ, Pedro
  • OOI, Aik
Agents
  • ZHANG, Clark
Priority Data
62/828,38602.04.2019US
62/828,40902.04.2019US
62/828,41602.04.2019US
62/828,42002.04.2019US
62/829,29104.04.2019US
62/829,35804.04.2019US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) METHODS, SYSTEMS, AND APARATUS FOR NUCLEIC ACID DETECTION
(FR) PROCÉDÉS, SYSTÈMES ET APPAREIL POUR LA DÉTECTION D'ACIDES NUCLÉIQUES
Abstract
(EN)
Provided herein are methods for detection and characterization of a target nucleic acid from a single cell. One embodiment is a method for detection of a BCR-ABL gene fusion in a nucleic acid sample from a single cell having or suspected of having a BCR-ABL fusion transcript. One preferred implementation of the invention includes providing a nucleic acid amplification primer set complementary to a target nucleic acid suspected of having a BCR-ABL fusion transcript. In some embodiments, one or both primers of the nucleic acid amplification primer set have a barcode identification sequence. Also provided are methods for the detection of an AML tumor, methods are used for the detection of a leukemia, for the detection of a myeloid leukemia, and to determine the prognosis of a patient suspected of having a BCR-ABL fusion transcript.
(FR)
L'invention concerne des procédés de détection et de caractérisation d'un acide nucléique cible à partir d'une seule cellule. Un mode de réalisation est un procédé de détection d'une fusion de gène BCR-ABL dans un échantillon d'acide nucléique à partir d'une seule cellule ayant ou suspecté d'avoir un transcrit de fusion BCR-ABL. Un mode de réalisation préféré de l'invention comprend l'utilisation d'un ensemble d'amorces d'amplification d'acide nucléique complémentaire d'un acide nucléique cible suspecté d'avoir un transcrit de fusion BCR-ABL. Dans certains modes de réalisation, une ou les deux amorces de l'ensemble d'amorces d'amplification d'acide nucléique ont une séquence d'identification à code-barres. L'invention concerne également des procédés de détection d'une tumeur AML, des procédés sont utilisés pour la détection d'une leucémie, pour la détection d'une leucémie myéloïde, et pour déterminer le pronostic d'un patient suspecté d'avoir un transcrit de fusion BCR-ABL.
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