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1. WO2020136216 - METHODS OF IDENTIFYING SUBJECTS HAVING OR AT RISK OF HAVING A COAGULATION RELATED DISORDER

Publication Number WO/2020/136216
Publication Date 02.07.2020
International Application No. PCT/EP2019/087038
International Filing Date 26.12.2019
IPC
C12Q 1/6883 2018.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6883for diseases caused by alterations of genetic material
CPC
C12Q 1/6883
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6883for diseases caused by alterations of genetic material
C12Q 2600/156
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
2600Oligonucleotides characterized by their use
156Polymorphic or mutational markers
Applicants
  • INSERM (INSTITUT NATIONAL DE LA SANTÉ ET DE LA RECHERCHE MÉDICALE) [FR]/[FR]
  • UNIVERSITÉ DE BORDEAUX [FR]/[FR]
  • UNIVERSITÉ D'AIX MARSEILLE [FR]/[FR]
  • ASSISTANCE PUBLIQUE HÔPITAUX DE MARSEILLE [FR]/[FR]
  • COMMISSARIAT À L'ÉNERGIE ATOMIQUE ET AUX ÉNERGIES ALTERNATIVES (CEA) [FR]/[FR]
  • SORBONNE UNIVERSITÉ [FR]/[FR]
  • INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE (INRA) [FR]/[FR]
Inventors
  • TREGOUET, David-Alexandre
  • MORANGE, Pierre-Emmanuel
  • DELEUZE, Jean-François
Agents
  • INSERM TRANSFERT
Priority Data
18306857.627.12.2018EP
19305977.124.07.2019EP
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) METHODS OF IDENTIFYING SUBJECTS HAVING OR AT RISK OF HAVING A COAGULATION RELATED DISORDER
(FR) PROCÉDÉS D'IDENTIFICATION DE SUJETS SOUFFRANT OU RISQUANT DE SOUFFRIR D'UN TROUBLE LIÉ À LA COAGULATION
Abstract
(EN)
Coagulation factor V (FV) plays an important and dual role in the regulation of blood coagulation by exhibiting both pro- and anticoagulant functions. In order to detect novel genetic loci participating to the regulation of Factor V (FV) plasma levels, the inventors conducted the first Genome Wide Association Study on this hemostatic phenotype in a sample of 510 individuals and replicated the main findings in an independent samples of 1156 individuals. In addition to genetic variations at the F5 locus, they identified novel associations at the PLXDC2 locus with the PLXDC2 rs927826 polymorphism explaining ~3.7% (p 7.5 10 -15 in the combined discovery and replication samples) of the variability of FV plasma levels. SiRNA experiments in human hepatocellular carcinoma cell line confirmed the role of PLXDC2 in modulating factor F5 gene expression. Accordingly, detecting a genetic variant in the PLXDC2 gene would be suitable for identifying a subject having or at risk of having a coagulation related disorder.
(FR)
Le facteur de coagulation 5 (F5) joue un rôle important et double dans la régulation de la coagulation sanguine en présentant à la fois des fonctions pro-et anticoagulante. Afin de détecter de nouveaux loci génétiques participant à la régulation du F5 les inventeurs ont conduit la première étude d'association large du génome sur ce phénotype hémostatique dans un échantillon de 510 individus et ont reproduit les mêmes résultats lors de l'analyse d'un échantillon indépendant de 1156 individus. Outre des variations génétiques au niveau du locus F5, les inventeurs ont identifié de nouvelles associations au niveau du locus PLXDC2 avec le polymorphisme PLXDC2 rs927826 expliquant environ 3,7 % (p 7,5 10-15 dans les échantillons combinés de découverte et de reproduction) de la variabilité des niveaux de F5 dans le plasma. Des expériences avec des ARNsi dans une lignée cellulaire de carcinome hépatocellulaire humain ont confirmé le rôle de PLXDC2 dans la modulation de l'expression génique du F5. En conséquence, la détection d'un variant génétique dans le gène PLXDC2 serait appropriée pour identifier un sujet souffrant ou risquant de souffrir d'un trouble lié à la coagulation.
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