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1. WO2020133588 - RAPID AND STABLE METHOD FOR EVALUATING INDIVIDUAL ANIMAL GENOME BREEDING VALUES

Publication Number WO/2020/133588
Publication Date 02.07.2020
International Application No. PCT/CN2019/071514
International Filing Date 14.01.2019
IPC
G16B 20/00 2019.01
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
CPC
G16B 20/00
GPHYSICS
16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
20ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
Applicants
  • 华中农业大学 HUAZHONG AGRICULTURAL UNIVERSITY [CN]/[CN]
  • 广州影子科技有限公司 GUANGZHOU YINGZI TECHNOLOGY CO., LTD. [CN]/[CN]
Inventors
  • 赵书红 ZHAO, Shuhong
  • 刘小磊 LIU, Xiaolei
  • 杨翔 YANG, Xiang
  • 李新云 LI, Xinyun
  • 朱猛进 ZHU, Mengjin
  • 项韬 XIANG, Tao
  • 马云龙 MA, Yunlong
  • 余梅 YU, Mei
  • 王志全 WANG, Zhiquan
  • 尹立林 YIN, Lilin
Agents
  • 沈阳东大知识产权代理有限公司 SHENYANG DONGDA INTELLECTUAL PROPERTY AGENCY CO., LTD
Priority Data
201811620927.X28.12.2018CN
Publication Language Chinese (ZH)
Filing Language Chinese (ZH)
Designated States
Title
(EN) RAPID AND STABLE METHOD FOR EVALUATING INDIVIDUAL ANIMAL GENOME BREEDING VALUES
(FR) PROCÉDÉ RAPIDE ET STABLE D'ÉVALUATION DE VALEURS INDIVIDUELLES DE REPRODUCTION DE GÉNOME D'ANIMAL
(ZH) 一种快速稳定的动物个体基因组育种值评估方法
Abstract
(EN)
Provided is a rapid and stable method for evaluating individual animal genome breeding values, relating to the field of animal breeding technology. The method uses HIBLUP to predict genomic breeding values using phenotype, genotype, and genealogical information, the final output comprising the estimated individual genetic value, the additive and dominant effect values of each individual, and the reverse parsing value of each genetic marker effect used in a genotyping chip. The method makes full use of genealogy, phenotype, and genotype information to predict the genetic value of each animal and the effect value of each SNP marker site, achieving the most advanced genomic breeding value prediction and variance component estimation algorithm to achieve genomic selection.
(FR)
L'invention concerne un procédé rapide et stable d'évaluation de valeurs individuelles de reproduction de génome d'animal, se rapportant au domaine de la technologie d'élevage d'animaux. Le procédé utilise HIBLUP pour prédire des valeurs de reproduction de génome à l'aide d'informations de phénotype, de génotype et de généalogie, la sortie finale comprenant la valeur génétique individuelle estimée, les valeurs d'effet additif et dominant de chaque individu, et la valeur d'analyse inverse de chaque effet de marqueur génétique utilisé dans une puce de génotypage. Le procédé utilise entièrement des informations de généalogie, de phénotype et de génotype pour prédire la valeur génétique de chaque animal et la valeur d'effet de chaque site de marqueur SNP, ce qui permet d'obtenir la prédiction de valeur de reproduction de génome et l'algorithme d'estimation de composante de variance les plus avancés pour obtenir une sélection de génome.
(ZH)
一种快速稳定的动物个体基因组育种值评估方法,涉及动物育种技术领域。该方法采用HIBLUP使用表型、基因型和谱系信息进行基因组育种值的预测,最终输出中包括估计的个体遗传价值、每个个体的加性效应和显性效应值以及用于基因分型芯片中的每个遗传标记效应的反向解析值。该方法全面利用谱系、表型和基因型信息来预测每个动物的遗传价值以及每个SNP标记位点的效应值,实现最先进的基因组育种值的预测和方差组分估计算法而实现基因组选择。
Also published as
Latest bibliographic data on file with the International Bureau