Processing

Please wait...

Settings

Settings

Goto Application

1. WO2020096858 - RAPID PCR METHODOLOGY

Publication Number WO/2020/096858
Publication Date 14.05.2020
International Application No. PCT/US2019/059150
International Filing Date 31.10.2019
IPC
C12Q 1/689 2018.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
6888for detection or identification of organisms
689for bacteria
Applicants
  • LONGHORN VACCINES AND DIAGNOSTICS, LLC [US]/[US]
Inventors
  • DAUM, Luke T.
  • FISCHER, Gerald W.
Agents
  • REMENICK, James
  • SMITH, Matthew
Priority Data
62/758,17309.11.2018US
62/773,56630.11.2018US
62/882,83105.08.2019US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) RAPID PCR METHODOLOGY
(FR) MÉTHODOLOGIE DE PCR RAPIDE
Abstract
(EN)
Disclosed is an enhanced method for rapid and cost-effective analysis of sequences of a microorganism by qPCR. These methods identify allelic variation, SNPs, and genetic mutations of a particular gene such as those responsible for conferring resistance or sensitivity to an antibiotic, chemotherapy, or another chemical compound. By selection of appropriate gene regions, mutation loci that confer resistance to key antibiotics can be identified by qPCR. Additionally, the approach can identify heteroresistant strains, e.g., populations of strains from a sample that contain both mutation and wild-type nucleotides. By selecting appropriate that bind efficiently to the area of mutation can identify resistance conferring mutations. Methods are useful to sequences derived from viral agents, such as influenza virus, bacterial agents, such as tuberculosis bacteria, and cancer cells.
(FR)
La présente invention concerne un procédé amélioré d'analyse rapide et peu coûteuse de séquences d'un microorganisme par PCR quantitative (qPCR). Ces procédés permettent d'identifier la variation allélique, les polymorphismes de nucléotide unique (SNP), les mutations génétiques d'un gène particulier, telles que les mutations responsables de la résistance ou de la sensibilité à un antibiotique, à la chimiothérapie, ou à un autre composé chimique. Par sélection de régions de gènes appropriées, des loci de mutation qui confèrent une résistance aux antibiotiques clés peuvent être identifiés par qPCR. De plus, l'approche peut identifier des souches hétérorésistantes, par exemple, des populations de souches d'un échantillon contenant à la fois une mutation et des nucléotides de type sauvage. Par la sélection d'éléments appropriés se liant efficacement à la zone de mutation, il est possible d'identifier des mutations conférant une résistance. Les procédés de l'invention s'avèrent utiles pour séquencer le génome d'agents viraux, comme les virus de la grippe, et d'agents bactériens, comme les bactéries responsables de la tuberculose.
Latest bibliographic data on file with the International Bureau