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1. WO2020091032 - COLORECTAL CANCER EXAMINATION METHOD

Publication Number WO/2020/091032
Publication Date 07.05.2020
International Application No. PCT/JP2019/042980
International Filing Date 01.11.2019
IPC
C12Q 1/6869 2018.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
6869Methods for sequencing
Applicants
  • 公益財団法人がん研究会 JAPANESE FOUNDATION FOR CANCER RESEARCH [JP]/[JP]
Inventors
  • 原 英二 HARA Eiji
  • 長山 聡 NAGAYAMA Satoshi
  • 吉本 真 YOSHIMOTO Shin
Agents
  • 白形 由美子 SHIRAKATA Yumiko
Priority Data
2018-20780202.11.2018JP
Publication Language Japanese (JA)
Filing Language Japanese (JA)
Designated States
Title
(EN) COLORECTAL CANCER EXAMINATION METHOD
(FR) PROCÉDÉ D'EXAMEN DE CANCER COLORECTAL
(JA) 大腸がんの検査方法
Abstract
(EN)
A diagnosis algorithm is established, which can detect colorectal cancer with high sensitivity by carrying out a meta-sequencing analysis of the sequence for 16S rRNA gene in an intestinal bacterium and employing an analysis method that brings a plurality of machine learning algorithms together. Furthermore, by analyzing early-stage cancer and advanced caner separately, it becomes possible to detect an early-stage colorectal cancer patient, who has not been detected easily so far, with high sensitivity. A colorectal cancer examination method that is non-invasive and has high sensitivity can be provided.
(FR)
La présente invention concerne un algorithme de diagnostic qui est établi, lequel peut détecter un cancer colorectal avec une sensibilité élevée par exécution d'une analyse de méta-séquençage de la séquence pour un gène d'ARNr 16S dans une bactérie intestinale et utilisation d'un procédé d'analyse qui rassemble une pluralité d'algorithmes d'apprentissage machine. En outre, en analysant séparément un cancer de stade précoce et un cancer avancé, il devient possible de détecter un patient atteint d'un cancer colorectal à un stade précoce, qui n'a pas été facilement détecté jusqu'à présent, avec une sensibilité élevée. L'invention concerne également un procédé d'examen du cancer colorectal qui est non invasif et qui présente une sensibilité élevée.
(JA)
腸内細菌の16S rRNA遺伝子配列のメタシークエンス解析を行い、複数の機械学習アルゴリズムを統合した解析方法により大腸がんを高感度で検出することのできる診断アルゴリズムを確立した。また、早期がん、進行がんを分けて解析することにより、今まで検出することが難しかった早期の大腸がん患者を高感度で検出することが可能となった。非侵襲的で感度の高い大腸がんの検査方法を提供できる。
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