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1. WO2020029521 - AUTOMATED METHOD FOR GENERATING ALL STEREOISOMERS OF ORGANIC MOLECULE

Publication Number WO/2020/029521
Publication Date 13.02.2020
International Application No. PCT/CN2018/123533
International Filing Date 25.12.2018
IPC
[IPC code unknown for G16C 20/50]
G16C 20/50 (2019.01)
Applicants
  • 深圳晶泰科技有限公司 SHENZHEN JINGTAI TECHNOLOGY CO., LTD. [CN/CN]; 中国广东省深圳市 龙华区大浪街道新石社区华联工业区9号4层 Floor 4, No.9, Hualian Industrial Zone, Xinshi Community, Dalang Street, Longhua District Shenzhen, Guangdong 518000, CN
Inventors
  • 张焕淮 ZHANG, Huanhuai; CN
  • 孙广旭 SUN, Guangxu; CN
  • 刘阳 LIU, Yang; CN
  • 温书豪 WEN, Shuhao; CN
  • 马健 MA, Jian; CN
  • 赖力鹏 LAI, Lipeng; CN
Agents
  • 深圳市科吉华烽知识产权事务所(普通合伙) SZ KINDWALF INTELLECTUAL PROPERTY FIRM; 中国广东省深圳市 南山区深南西路深南花园裙楼A区四层402室 Room 402, 4/F, Building A, Shennan Garden, Shennan West Road, Nanshan District Shenzhen, Guangdong 518057, CN
Priority Data
Publication Language Chinese (ZH)
Filing Language Chinese (ZH)
Designated States
Title
(EN) AUTOMATED METHOD FOR GENERATING ALL STEREOISOMERS OF ORGANIC MOLECULE
(FR) PROCÉDÉ AUTOMATISÉ DE GÉNÉRATION DE TOUS LES STÉRÉOISOMÈRES D'UNE MOLÉCULE ORGANIQUE
(ZH) 有机分子的立体异构全集自动化生成方法
Abstract
(EN)
The present invention relate to the field of organic molecule simulation and calculation, and specifically relates to an automated method for generating all stereoisomers of an organic molecule. (1) Dividing an inputted molecule into a group of fragments; (2) matching the obtained heterogeneous fragments to fragment templates in a fragment template library; (3) according to the fragment template information, generating all isomers corresponding to segments; (4) traversing all heterogeneous fragments and sites thereof, assembling the fragments at the two ends of the broken bond in step (1) at all possible sites of the atom of which the bond is broken, so as to obtain all stereoisomers; if filtering is necessary, preforming filtering according to a specified filtering rule. The present invention conveniently describes stereoisomers similar to the fragments, substantially reduces the number of fragments, and markedly reduces the difficulty of constructing a fragment library. Fragment division, traversal of all stereoisomers of fragments, and assembly and splicing according to sites can easily generate all stereoisomers of a molecule.
(FR)
La présente invention concerne le domaine de la simulation et du calcul de molécules organiques et, spécifiquement, un procédé automatisé pour générer tous les stéréoisomères d'une molécule organique. (1) Diviser une molécule entrée en un groupe de fragments ; (2) mettre en correspondance les fragments hétérogènes obtenus avec des modèles de fragments d'une bibliothèque de modèles de fragments ; (3) selon les informations relatives aux modèles de fragments, générer tous les isomères correspondant à des segments ; (4) en parcourant tous les fragments hétérogènes et leurs sites, assembler les fragments aux deux extrémités de la liaison rompue à l'étape (1) au niveau de tous les sites possibles de l'atome dont la liaison est rompue, de manière à obtenir tous les stéréoisomères ; si un filtrage est nécessaire, concevoir le filtrage selon une règle de filtrage spécifiée. La présente invention décrit avantageusement des stéréoisomères similaires aux fragments, réduit sensiblement le nombre de fragments et réduit nettement la difficulté d'élaboration d'une bibliothèque de fragments. La division des fragments, la prise en considération de tous les stéréoisomères des fragments, et l'assemblage et l'épissage selon les sites peuvent facilement générer tous les stéréoisomères d'une molécule.
(ZH)
本发明属于有机分子模拟计算领域,具体涉及一种有机分子的立体异构全集自动化生成方法,(1)将输入分子切分成一组片段;(2)用得到的异构片段到片段模板库中匹配片段模板;(3)根据片段模板信息生成出对应片段的所有异构;(4)遍历所有的异构片段及其位点,将步骤(1)中断的键两端的片段,按断键原子的所有可能的位点进行组装,得到所有的立体异构;如果需要过滤,则可以按照指定的过滤规则进行过滤。本发明可以很方便的描述相似片段的立体异构,并大量减少片段数量,极大地降低片段库的构建难度。分片段,再遍历片段的所有立体异构,然后根据位点组合拼装,可以容易地生成一个分子的所有立体异构。
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