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1. WO2020006370 - NUCLEIC ACID REARRANGEMENT AND INTEGRATION ANALYSIS

Publication Number WO/2020/006370
Publication Date 02.01.2020
International Application No. PCT/US2019/039750
International Filing Date 28.06.2019
IPC
[IPC code unknown for G16B 30]
[IPC code unknown for G16B 40]
[IPC code unknown for G16B 20/10]
G16B 30/00 (2019.01)
G16B 40/00 (2019.01)
G16B 20/10 (2019.01)
CPC
C12Q 1/6886
C12Q 1/701
C12Q 1/706
C12Q 1/707
C12Q 1/708
C12Q 2600/156
Applicants
  • GRAIL, INC. [US/US]; 1525 O'Brien Drive Menlo Park, California 94025, US
Inventors
  • LO, Yuk-Ming Dennis; CN
  • CHIU, Rossa Wai Kwun; CN
  • CHAN, Kwan Chee; CN
  • JIANG, Peiyong; CN
  • LAM, Wai Kei; CN
  • ZHANG, Haiqiang; CN
Agents
  • HUANG, Wei; US
Priority Data
62/691,89029.06.2018US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) NUCLEIC ACID REARRANGEMENT AND INTEGRATION ANALYSIS
(FR) ANALYSE D'INTÉGRATION ET DE RÉARRANGEMENT D'ACIDES NUCLÉIQUES
Abstract
(EN)
Provided herein are methods and systems for identifying chimeric nucleic acid fragments, e.g., organism-pathogen chimeric nucleic acid fragments and chromosomal rearrangement chimeric nucleic acid fragments. Also provided herein are methods and systems relating to determining a pathogen integration profile or a chromosomal rearrangement in a biological sample and determining a classification of pathology based at least in part on a pathogen integration profile or a chromosomal rearrangement in a biological sample. In certain aspects of the present disclosure, cell-free nucleic acid molecules from a biological sample are analyzed.
(FR)
L'invention concerne des procédés et des systèmes pour identifier des fragments d'acides nucléiques chimériques, par exemple, des fragments d'acides nucléiques chimériques de pathogènes d'organismes et des fragments d'acides nucléiques chimériques de réarrangements chromosomiques. L'invention concerne également des procédés et des systèmes relatifs à la détermination d'un profil d'intégration de pathogènes ou d'un réarrangement chromosomique dans un échantillon biologique et à la détermination d'une classification de pathologie sur la base, au moins en partie, d'un profil d'intégration de pathogènes ou d'un réarrangement chromosomique dans un échantillon biologique. Selon certains aspects de la présente invention, des molécules d'acides nucléiques acellulaires en provenance d'un échantillon biologique sont analysées.
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