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1. WO2020006067 - CRISPR DOUBLE NICKASE BASED AMPLIFICATION COMPOSITIONS, SYSTEMS, AND METHODS

Publication Number WO/2020/006067
Publication Date 02.01.2020
International Application No. PCT/US2019/039221
International Filing Date 26.06.2019
IPC
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
[IPC code unknown for C12Q 1/6844]
C12Q 1/68 (2018.01)
C12Q 1/6844 (2018.01)
CPC
C12Q 1/68
C12Q 1/6844
Applicants
  • THE BROAD INSTITUTE, INC. [US/US]; 415 Main Street Cambridge, Massachusetts 02142, US
  • MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY [US/US]; 77 Massachusetts Avenue Cambridge, Massachusetts 02139, US
  • PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE [US/US]; 17 Quincy Street Cambridge, Massachusetts 02138, US
Inventors
  • ZHANG, Feng; US
  • KELLNER, Max; US
  • GOOTENBERG, Jonathan; US
  • ABUDAYYEH, Omar; US
Agents
  • NIX, F. Brent; US
  • RUTLEDGE, Rachel; US
Priority Data
62/690,27826.06.2018US
62/767,05914.11.2018US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) CRISPR DOUBLE NICKASE BASED AMPLIFICATION COMPOSITIONS, SYSTEMS, AND METHODS
(FR) COMPOSITIONS, SYSTÈMES ET PROCÉDÉS D'AMPLIFICATION À BASE DE DOUBLE NICKASE DE CRISPR
Abstract
(EN)
The embodiments disclosed herein utilized RNA targeting effectors to provide robust CRISPR-based nucleic acid amplification methods and systems. Embodiments disclosed herein can amplify both double-stranded and single-stranded nucleic acid targets. Moreover, the embodiments disclosed herein can be combined with various detection platforms, for example, CRISPR-SHERLOCK, to achieve detection and diagnostic with attomolar sensitivity. Such embodiments are useful in multiple scenarios in human health including, for example, viral detection, bacterial strain typing, sensitive genotyping, and detection of disease-associated cell free DNA.
(FR)
Des modes de réalisation de la présente invention utilisent des effecteurs ciblant l'ARN pour fournir des procédés et des systèmes d'amplification d'acides nucléiques à base de CRISPR robustes. Des modes de réalisation de la présente invention peuvent amplifier des cibles d'acides nucléiques à double brin et à simple brin. De plus, des modes de réalisation de la présente invention peuvent être combinés à diverses plateformes de détection, par exemple, CRISPR-SHERLOCK, pour obtenir une détection et un diagnostic avec une sensibilité attomolaire. De tels modes de réalisation sont utiles dans de multiples scénarios dans le domaine de la santé humaine, notamment, par exemple, pour la détection virale, le typage de souches bactériennes, le génotypage sensible et la détection d'ADN libre circulant associé à des maladies.
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