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1. WO2020006036 - CRISPR EFFECTOR SYSTEM BASED AMPLIFICATION METHODS, SYSTEMS, AND DIAGNOSTICS

Publication Number WO/2020/006036
Publication Date 02.01.2020
International Application No. PCT/US2019/039167
International Filing Date 26.06.2019
IPC
[IPC code unknown for C12Q 1/6844]
C12Q 1/6844 (2018.01)
CPC
C12Q 1/6846
Applicants
  • MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY [US/US]; 77 Massachusetts Avenue Cambridge, Massachusetts 02139, US
  • THE BROAD INSTITUTE, INC. [US/US]; 415 Main Street Cambridge, Massachusetts 02142, US
  • PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE [US/US]; 17 Quincy Street Cambridge, Massachusetts 02138, US
Inventors
  • ZHANG, Feng; US
  • KELLNER, Max; US
  • GOOTENBERG, Jonathan; US
  • ABUDAYYEH, Omar; US
Agents
  • NIX, F. Brent; US
  • REY, Gertrud U.; US
Priority Data
62/690,25726.06.2018US
62/767,05214.11.2018US
62/818,65014.03.2019US
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) CRISPR EFFECTOR SYSTEM BASED AMPLIFICATION METHODS, SYSTEMS, AND DIAGNOSTICS
(FR) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES D'AMPLIFICATION FONDÉS SUR UN SYSTÈME EFFECTEUR CRISPR ET DIAGNOSTICS ASSOCIÉS
Abstract
(EN)
Provided herein are methods and systems for amplifying and/or detecting target double-stranded or single-stranded nucleic acids. The methods comprise combining a sample comprising the target nucleic acid with an amplification reaction mixture, amplifying the target nucleic acid, and further amplifying the target nucleic acid by repeated opening, unwinding, annealing and extension under isothermal conditions. The amplification reaction mixture may include an amplification CRISPR system, a helicase, a primer pair, and a polymerase. The amplification CRISPR system may comprise a first and second CRISPR/Cas complex, the first and second CRISPR/Cas complex may comprise a first CRISPR/Cas enzyme and a first guide molecule that guides the first CRISPR/Cas complex to a first strand of the target nucleic acid; the second CRISPR/Cas complex may comprise a second CRISPR/Cas enzyme and a second guide molecule that guides the second CRISPR/Cas complex to a second strand of the target nucleic acid.
(FR)
L'invention concerne des procédés et des systèmes pour l'amplification et/ou la détection d'acides nucléiques double brin ou simple brin cibles. Les procédés comprennent la combinaison d'un échantillon comprenant l'acide nucléique cible avec un mélange pour réaction d'amplification, l'amplification de l'acide nucléique cible et une nouvelle amplification de l'acide nucléique cible par répétition de l'ouverture, du déroulement, de l'hybridation et de l'extension dans des conditions isothermes. Le mélange pour réaction d'amplification peut comprendre un système CRISPR d'amplification, une hélicase, une paire d'amorces et une polymérase. Le système CRISPR d'amplification peut comprendre des premier et second complexes CRISPR/Cas, les premier et second complexes CRISPR/Cas peuvent comprendre une première enzyme CRISPR/Cas et une première molécule de guidage qui guide le premier complexe CRISPR/Cas vers un premier brin de l'acide nucléique cible ; le second complexe CRISPR/Cas peut comprendre une seconde enzyme CRISPR/Cas et une seconde molécule de guidage qui guide le second complexe CRISPR/Cas vers un second brin de l'acide nucléique cible.
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