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1. (WO2019063783) METHODS FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING PULMONARY COLONIZATION/INFECTION BY PSEUDOMONAS AERUGINOSA
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Pub. No.: WO/2019/063783 International Application No.: PCT/EP2018/076442
Publication Date: 04.04.2019 International Filing Date: 28.09.2018
IPC:
C12Q 1/68 (2018.01) ,C12Q 1/6883 (2018.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
[IPC code unknown for C12Q 1/6883]
Applicants:
INSERM (INSTITUT NATIONAL DE LA SANTÉ ET DE LA RECHERCHE MÉDICALE) [FR/FR]; 101, rue de Tolbiac 75013 Paris, FR
UNIVERSITÉ DE BRETAGNE OCCIDENTALE [FR/FR]; 3 rue des Archives 29238 Brest, FR
ETABLISSEMENT FRANÇAIS DU SANG (EFS) [FR/FR]; 20 avenue du Stade de France 93210 La Plaine Saint Denis, FR
INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE (INRA) [FR/FR]; 147, rue de l'Université 75007 Paris, FR
CENTRE HOSPITALIER REGIONAL ET UNIVERSITAIRE DE BREST [FR/FR]; 5 AVENUE MARECHAL FOCH 29200 Brest, FR
Inventors:
HERY-ARNAUD, Geneviève; FR
MOUNIER, Jérôme; FR
KERAVEC, Marlène; FR
MONDOT, Stanislas; FR
LEPAGE, Patricia; FR
GUILLOUX, Charles-Antoine; FR
Agent:
INSERM TRANSFERT; 7 rue Watt 75013 Paris, FR
Priority Data:
17306297.729.09.2017EP
17306717.407.12.2017EP
Title (EN) METHODS FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING PULMONARY COLONIZATION/INFECTION BY PSEUDOMONAS AERUGINOSA
(FR) PROCÉDÉS POUR PRÉDIRE LE RISQUE DE DÉVELOPPER UNE COLONISATION/INFECTION PULMONAIRE PAR PSEUDOMONAS AERUGINOSA
Abstract:
(EN) The present invention relates to methods for predicting the risk of developing pulmonary colonization/infection by P. aeruginosa. The inventors analyzed the respiratory tract microbiota from 65 patients sputum samples and compared microbiota data. The inventors found that patients that will remain uninfected from P. aeruginosa exhibited 3-fold higher abundance of Porphyromonas compared to the other groups. In particular, the present invention relates to a method for predicting the risk of developing pulmonary colonization/infection by P. aeruginosa in a subject suffering from cystic fibrosis (CF) comprising measuring the abundance of Porphyromonas genus bacteria in a biological sample obtained from said subject.
(FR) La présente invention concerne des procédés pour prédire le risque de développer une colonisation/infection pulmonaire par P. aeruginosa. Les inventeurs ont analysé le microbiote du tractus respiratoire à partir de 65 échantillons de crachats de patients et de données de microbiote comparées. Les inventeurs ont découvert que les patients qui restent non infectés par P. aeruginosa présentaient une abondance de Porphyromonas supérieure à 3 fois celle des autres groupes. En particulier, la présente invention concerne un procédé pour prédire le risque de développer une colonisation/infection pulmonaire par P. aeruginosa chez un sujet souffrant de fibrose kystique (CF) comprenant la mesure de l'abondance de bactéries du genre Porphyromonas dans un échantillon biologique obtenu à partir dudit sujet.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Office (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)