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1. (WO2019063617) IMPROVED COMPUTING DEVICE
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Pub. No.: WO/2019/063617 International Application No.: PCT/EP2018/076134
Publication Date: 04.04.2019 International Filing Date: 26.09.2018
IPC:
G06F 19/22 (2011.01)
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
19
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific applications
10
Bioinformatics, i.e. methods or systems for genetic or protein-related data processing in computational molecular biology
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for sequence comparison involving nucleotides or amino acids, e.g. homology search, motif or SNP [Single-Nucleotide Polymorphism] discovery or sequence alignment
Applicants:
UNIVERSITÉ DU LUXEMBOURG [LU/LU]; 162a, avenue de la Faïencerie 1511 Luxembourg, LU
Inventors:
DECOUCHANT, Jeremie; LU
ESTEVES-VERISSIMO, Paulo; LU
FERNANDES, Maria; LU
Agent:
MARKS & CLERK (LUXEMBOURG) LLP; 44, rue de la Vallée 2661 Luxembourg, LU
Priority Data:
LU10044926.09.2017LU
Title (EN) IMPROVED COMPUTING DEVICE
(FR) DISPOSITIF DE CALCUL AMÉLIORÉ
Abstract:
(EN) Genomics information such as DNA, RNA and proteins carry a wealth of sensitive information, the exposure of which risks compromising the privacy and/or business interests of individuals and companies. An apparatus, a system and methods are disclosed for protecting sensitive genomic information either as it is produced by a sequencing machine or immediately thereafter, then throughout the whole genomic workflow. Raw genomic data ("reads") is detected and classified according to sensitivity. Reads are decomposed by excising the number and type of detected sensitive base or base pairs in less sensitive or insensitive parts of the read. The genomic workflow processes the excised information locally or in a distributed fashion, preferably within trusted execution environments for increased security.
(FR) Selon la présente invention, des informations génomiques telles que l'ADN, l'ARN et les protéines transportent une mine d'informations sensibles, dont l'exposition de ces dernières risque de compromettre la confidentialité et/ou les intérêts commerciaux d'individus et de sociétés. Un appareil, un système et des procédés sont décrits pour protéger des informations génomiques sensibles du fait qu'elles sont soit produites par une machine de séquençage, soit immédiatement après, puis dans tout le flux de travaux génomiques. Des données génomiques brutes ("lectures") sont détectées et classées en fonction de la sensibilité. Les lectures sont décomposées par excision du nombre et du type de paires de base ou de base sensibles détectées dans des parties moins sensibles ou insensibles de la lecture. Le flux de travaux génomiques traite les informations excisées localement ou de manière distribuée, de préférence dans des environnements d'exécution de confiance pour une sécurité accrue.
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Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
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European Patent Office (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)