Processing

Please wait...

Settings

Settings

Goto Application

1. WO2019053430 - SINGLE-MOLECULE PHENOTYPING AND SEQUENCING OF NUCLEIC ACID MOLECULES

Publication Number WO/2019/053430
Publication Date 21.03.2019
International Application No. PCT/GB2018/052598
International Filing Date 13.09.2018
IPC
C12Q 1/6874 2018.01
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68involving nucleic acids
6869Methods for sequencing
6874involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
CPC
C12Q 1/6874
CCHEMISTRY; METALLURGY
12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS
1Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms
68involving nucleic acids
6869Methods for sequencing
6874involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
Applicants
  • OXFORD UNIVERSITY INNOVATION LTD. [GB]/[GB]
Inventors
  • KAPANIDIS, Achillefs
  • ANDREWS, Rebecca
Agents
  • BARKER BRETTELL LLP
Priority Data
1714748.913.09.2017GB
Publication Language English (EN)
Filing Language English (EN)
Designated States
Title
(EN) SINGLE-MOLECULE PHENOTYPING AND SEQUENCING OF NUCLEIC ACID MOLECULES
(FR) PHÉNOTYPAGE ET SÉQUENÇAGE MONOMOLÉCULAIRES DE MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE
Abstract
(EN)
This invention relates to a method of sequencing a nucleic acid molecule, in particular the method comprising: (a) providing the nucleic acid immobilised on a surface; (b) forming a single-stranded gap section by partially duplexing the nucleic acid such that the single-stranded gap section is flanked by duplex sections, wherein the sequence to be sequenced is a sequence of the single-stranded gap section; (c) providing a set of at least four fluorescently labelled oligonucleotide probes, (d) detecting binding, or absence thereof, of the fluorescently labelled oligonucleotide probes with the gap section of the immobilised nucleic acid, wherein the identity of the interrogated nucleotide of the gap section of the immobilised nucleic acid is identified as the complementary base of the nucleotide X of the fluorescently labelled oligonucleotide probe that has the highest incidence of binding; (e) repeating steps (c) and (d) for interrogating subsequent nucleotide positions of the gap section of the immobilised nucleic acid until sufficient nucleotides of the gap section have been identified to be able to determine a sequence. Also provided are methods of single-molecule phenotyping and sequencing; methods of single-molecule phenotyping and identification of a molecule tagged with nucleic acid; an immobilised nucleic acid molecule; and a composition comprising oligonucleotide probes.
(FR)
La présente invention concerne un procédé de séquençage d'une molécule d'acide nucléique, le procédé comprenant en particulier : (a) la fourniture de l'acide nucléique immobilisé sur une surface ; (b) la formation d'une section de brèche simple brin par le duplexage partiel de l'acide nucléique de telle sorte que la section de brèche simple brin est flanquée de sections duplex, la séquence à séquencer étant une séquence de la section de brèche simple brin ; (c) la fourniture d'un ensemble d'au moins quatre sondes oligonucléotidiques marquées par fluorescence ; (d) la détection de la fixation, ou de l'absence de celle-ci, des sondes oligonucléotidiques marquées par fluorescence avec la section de brèche de l'acide nucléique immobilisé, l'identité du nucléotide interrogé de la section de brèche de l'acide nucléique immobilisé étant identifiée comme étant la base complémentaire du nucléotide X de la sonde oligonucléotidique marquée par fluorescence qui a l'incidence la plus élevée de fixation ; (e) la répétition des étapes (c) et (d) pour interroger des positions nucléotidiques ultérieures de la section de brèche de l'acide nucléique immobilisé jusqu'à ce que suffisamment de nucléotides de la section de brèche aient été identifiés pour pouvoir déterminer une séquence. L'invention concerne également des procédés de phénotypage et de séquençage monomoléculaire ; des procédés de phénotypage et d'identification monomoléculaire d'une molécule marquée avec un acide nucléique ; une molécule d'acide nucléique immobilisée ; et une composition comprenant des sondes oligonucléotidiques.
Also published as
Latest bibliographic data on file with the International Bureau