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1. (WO2019027767) SEQUENCING SYSTEM WITH MULTIPLEXED BIOLOGICAL SAMPLE AGGREGATION
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Pub. No.: WO/2019/027767 International Application No.: PCT/US2018/043744
Publication Date: 07.02.2019 International Filing Date: 25.07.2018
IPC:
G16H 10/40 (2018.01) ,G06F 19/22 (2011.01)
[IPC code unknown for G16H 10/40]
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
19
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific applications
10
Bioinformatics, i.e. methods or systems for genetic or protein-related data processing in computational molecular biology
22
for sequence comparison involving nucleotides or amino acids, e.g. homology search, motif or SNP [Single-Nucleotide Polymorphism] discovery or sequence alignment
Applicants:
ILLUMINA INC. [US/US]; 5200 Illumina Way San Diego, CA 92122, US
Inventors:
SMITH, Eric; US
BIERLE, James; US
KIM, Sean; US
ARAGON, Tyler; US
CRUZ, Pedro; US
CONSTANDSE, Rodger; US
Agent:
MAURER, Gregory, L.; US
Priority Data:
62/539,40231.07.2017US
Title (EN) SEQUENCING SYSTEM WITH MULTIPLEXED BIOLOGICAL SAMPLE AGGREGATION
(FR) SYSTÈME DE SÉQUENÇAGE COMPORTANT UNE AGRÉGATION D'ÉCHANTILLONS BIOLOGIQUES MULTIPLEXÉS
Abstract:
(EN) A wide variety of scenarios are supported for per-biosample aggregation of sequencing yield. A sequencing system can sequence a plurality of biosamples in parallel. As sequencing yield results are acquired, they can be matched to biosamples and sequencing progress for the biosamples can be monitored. A target amount of yield can be specified so that a sequencing yield analysis application is automatically launched when aggregated yield reaches the target. Other features related to quality control and yield-in-progress can result in more efficient sequencing activities and reduction in waste.
(FR) L'invention concerne une grande variété de scénarios qui sont pris en charge en vue d'une agrégation par échantillon biologique de rendement de séquençage. Un système de séquençage peut séquencer une pluralité d'échantillons biologiques en parallèle. À mesure que des résultats de rendement de séquençage sont acquis, ils peuvent être mis en correspondance avec des échantillons biologiques, et une progression de séquençage pour les échantillons biologiques peut être surveillée. Une quantité cible de rendement peut être spécifiée de telle sorte qu'une application d'analyse de rendement de séquençage est automatiquement lancée lorsque le rendement agrégé atteint la cible. D'autres caractéristiques liées au contrôle de qualité et au rendement en cours peuvent entraîner des activités de séquençage plus efficaces et une réduction des déchets.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)