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1. (WO2019025514) AUTOMATED METHODS AND SYSTEMS FOR DETECTING CELLS IN STAINED SPECIMEN IMAGES
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Pub. No.: WO/2019/025514 International Application No.: PCT/EP2018/070923
Publication Date: 07.02.2019 International Filing Date: 02.08.2018
IPC:
G06T 7/10 (2017.01) ,G06K 9/00 (2006.01)
[IPC code unknown for G06T 7/10]
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
K
RECOGNITION OF DATA; PRESENTATION OF DATA; RECORD CARRIERS; HANDLING RECORD CARRIERS
9
Methods or arrangements for reading or recognising printed or written characters or for recognising patterns, e.g. fingerprints
Applicants:
VENTANA MEDICAL SYSTEMS, INC. [US/US]; 1910 E. Innovation Park Dr, Tucson, Arizona 85755, US
F. HOFFMANN-LA ROCHE AG [CH/CH]; Grenzacherstrasse 124 4070 Basel, CH (CL)
Inventors:
GUETTER, Christoph; US
NGUYEN, Kien; US
WANG, XiuZhong; US
Agent:
GYENGE, Zoltan; CH
Priority Data:
62/541,63004.08.2017US
Title (EN) AUTOMATED METHODS AND SYSTEMS FOR DETECTING CELLS IN STAINED SPECIMEN IMAGES
(FR) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES AUTOMATISÉS PERMETTANT DE DÉTECTER DES CELLULES DANS DES IMAGES D'ÉCHANTILLONS COLORÉES
Abstract:
(EN) A system and a method for unveiling poorly visible or lightly colored nuclei in an input image are disclosed. An input image (210) is fed to a color deconvolution module (220) for deconvolution into two color channels that are processed separately before being combined. The input image is deconvolved into two separate images: a stain image (230) and a counter stain image (250). A complement of the stain image (234) is generated in order to clearly reflect the locations of the poorly visible or light-colored nuclei. The complement image and the counter stain image are optionally normalized (236, 264) and then combined (270) and segmented (275), to generate an output image (280) with clearly defined nuclei. Alternatively, the complement of the stain image and the counter stain image can optionally be normalized, and then segmented prior to being combined to generate the output image.
(FR) La présente invention concerne un système et un procédé qui permettent de dévoiler des noyaux faiblement visibles ou légèrement colorés dans une image d'entrée. Une image d'entrée est fournie à un module de déconvolution de couleur pour une déconvolution en deux canaux de couleur qui sont traités séparément avant d'être combinés. L'image d'entrée est déconvolutionnée en deux images distinctes : une image de coloration ; et une image de contre-coloration. Un complément de l'image de coloration est généré afin de réfléchir de manière claire les emplacements des noyaux faiblement visibles ou légèrement colorés. L'image de complément et l'image de contre-coloration sont éventuellement normalisées puis combinées et segmentées, afin de générer une image de sortie ayant des noyaux clairement définis. En variante, le complément de l'image de coloration et l'image de contre-coloration peuvent éventuellement être normalisés, puis segmentés avant d'être combinés pour générer l'image de sortie.
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Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)