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1. (WO2019005978) METHODS OF SUPPRESSING ADAPTOR DIMER FORMATION IN DEEP SEQUENCING LIBRARY PREPARATION
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Pub. No.: WO/2019/005978 International Application No.: PCT/US2018/039771
Publication Date: 03.01.2019 International Filing Date: 27.06.2018
IPC:
C12Q 1/6855 (2018.01)
[IPC code unknown for C12Q 1/6855]
Applicants:
SACHIDANANDAM, Ravi [US/US]; US
ICAHN SCHOOL OF MEDICINE AT MOUNT SINAI [US/US]; One Gustave L. Levy Place P.o. Box 1675 New York, NY 10029, US
Inventors:
SACHIDANANDAM, Ravi; US
Agent:
MILLER, Amanda, M.; US
PRIBISICH, Risto; US
KERN, Benjamin; US
ANDERSON, Kraig; US
KENDRICK, Thomas; US
Priority Data:
62/525,43727.06.2017US
Title (EN) METHODS OF SUPPRESSING ADAPTOR DIMER FORMATION IN DEEP SEQUENCING LIBRARY PREPARATION
(FR) PROCÉDÉS DE SUPPRESSION DE LA FORMATION DE DIMÈRES D'ADAPTATEUR DANS UNE PRÉPARATION DE BIBLIOTHÈQUE DE SÉQUENÇAGE PROFOND
Abstract:
(EN) Disclosed are methods of suppressing adaptor dimer formation comprising: providing a target polynucleotide with a 5' and 3' end; providing a double stranded DNA adaptor with a 5' end and a 3' end that have sequence complementary to each other, ligating the double stranded adaptor to the target polynucleotide to form a ligation product. Also provided is a method of preparing a library of nucleic acid sequences comprising: providing a double-stranded DNA adaptor with 5' and 3' ends having a sequence complementary to each other, contacting the adaptor with a target nucleic acid sequences having a 5' and a 3' end, and ligating the adaptor with complementary sequence to the 5' and 3' ends of the target nucleic acid sequence using a double stranded DNA ligase. The disclosure also provides kits for suppression of adaptor dimer formation in deep sequencing containing a double stranded DNA adaptor with 5' and 3' ends having a sequence complementary to each other, suitable enzymes, buffers, dNTPS, etc.
(FR) L'invention concerne des procédés de suppression de la formation de dimères d'adaptateur comprenant : la fourniture d'un polynucléotide cible ayant une extrémité 5' et une extrémité 3' ; l'utilisation d'un adaptateur d'ADN bicaténaire avec une extrémité 5' et une extrémité 3' qui ont des séquences complémentaires l'une de l'autre, la ligature de l'adaptateur bicaténaire au polynucléotide cible pour former un produit de ligature. L'invention concerne également un procédé de préparation d'une bibliothèque de séquences d'acide nucléique comprenant : la fourniture d'un adaptateur d'ADN bicaténaire avec des extrémités 5' et 3' ayant des séquences complémentaires l'une de l'autre, la mise en contact de l'adaptateur avec des séquences d'acide nucléique cible ayant une extrémité 5' et une extrémité 3', et la ligature de l'adaptateur avec une séquence complémentaire aux extrémités 5'et 3' de la séquence d'acide nucléique cible à l'aide d'une ligase d'ADN bicaténaire. L'invention concerne également des kits pour la suppression de la formation de dimères d'adaptateur dans un séquençage profond contenant un adaptateur d'ADN bicaténaire avec des extrémités 5' et 3' ayant des séquences complémentaires l'une de l'autre, des enzymes appropriées, des tampons, des dNTPS, etc.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Office (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)