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1. (WO2018200847) METHODS OF PRODUCING RIBOSOMAL RIBONUCLEIC ACID COMPLEXES
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Pub. No.: WO/2018/200847 International Application No.: PCT/US2018/029613
Publication Date: 01.11.2018 International Filing Date: 26.04.2018
IPC:
C12Q 1/6869 (2018.01) ,C12Q 1/689 (2018.01)
[IPC code unknown for C12Q 1/6869][IPC code unknown for C12Q 1/689]
Applicants:
THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA [US/US]; 1111 Franklin Street, 12th Floor Oakland, California 94607, US
Inventors:
SMITH, Andrew M.; US
JAIN, Miten; US
Agent:
DAVY, Brian E.; US
Priority Data:
62/490,99227.04.2017US
Title (EN) METHODS OF PRODUCING RIBOSOMAL RIBONUCLEIC ACID COMPLEXES
(FR) PROCÉDÉS DE PRODUCTION DE COMPLEXES D'ACIDE RIBONUCLÉIQUE RIBOSOMIQUE
Abstract:
(EN) Provided are methods of producing a nucleic acid complex. In certain aspects, the methods include combining a sample including ribosomal RNA (rRNA) and a probe complement oligonucleotide with an oligonucleotide probe. The oligonucleotide probe includes a 3' region complementary to a 3' region of a rRNA, and a 5' region complementary to the probe complement oligonucleotide. The combining is under conditions in which the 3' region of the oligonucleotide probe hybridizes to the 3' region of the rRNA and the 5' region of the oligonucleotide probe hybridizes to the probe complement oligonucleotide, thereby producing a nucleic acid complex. In certain aspects, the methods find use in producing rRNA libraries that find use, e.g., in rRNA sequencing applications. Oligonucleotide probes, libraries thereof, compositions, and kits that find use, e.g., in practicing the methods of the present disclosure, are also provided.
(FR) La présente invention concerne des procédés de production d'un complexe d’acide nucléique. Dans certains aspects, les procédés comprennent la combinaison d'un échantillon comprenant un ARN ribosomique (ARNr) et un oligonucléotide complémentaire de sonde avec une sonde oligonucléotidique. La sonde oligonucléotidique comprend une région 3' complémentaire à une région 3' d'un ARNr et une région 5' complémentaire de l'oligonucléotide complémentaire de sonde. La combinaison se fait dans des conditions dans lesquelles la région 3' de la sonde oligonucléotidique s'hybride à la région 3' de l'ARNr et la région 5' de la sonde oligonucléotidique s'hybride à l'oligonucléotide complémentaire de sonde, produisant ainsi un complexe d'acide nucléique. Dans certains aspects, les procédés trouvent une utilisation dans la production de bibliothèques d'ARNr qui trouvent une utilisation, par exemple, dans des applications de séquençage d'ARNr. La présente invention décrit également des sondes oligonucléotidiques, des bibliothèques correspondantes, des compositions et des kits qui trouvent une utilisation, par exemple, dans la réalisation des procédés de la présente divulgation.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)