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1. (WO2018165530) METHOD OF CONSTRUCTING A REUSABLE LOW-DIMENSIONALITY MAP OF HIGH-DIMENSIONALITY DATA
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Pub. No.: WO/2018/165530 International Application No.: PCT/US2018/021711
Publication Date: 13.09.2018 International Filing Date: 09.03.2018
IPC:
G01N 21/64 (2006.01) ,G01N 33/49 (2006.01) ,G01N 33/50 (2006.01) ,G06F 17/18 (2006.01) ,G06F 17/30 (2006.01)
G PHYSICS
01
MEASURING; TESTING
N
INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
21
Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using infra-red, visible, or ultra-violet light
62
Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
63
optically excited
64
Fluorescence; Phosphorescence
G PHYSICS
01
MEASURING; TESTING
N
INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33
Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/-G01N31/131
48
Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
483
Physical analysis of biological material
487
of liquid biological material
49
blood
G PHYSICS
01
MEASURING; TESTING
N
INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33
Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/-G01N31/131
48
Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
50
Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
17
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific functions
10
Complex mathematical operations
18
for evaluating statistical data
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
17
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific functions
30
Information retrieval; Database structures therefor
Applicants:
CYTOVAS LLC [US/US]; 3401 Grays Ferry Avenue Philadelphia, PA 19146, US
Inventors:
ROGERS, Wade, T.; US
Agent:
RYAN, Michael; US
BEARDELL, Louis, W.; US
DAVIS, Kenneth, J.; US
GRIFFIN, Gail, H.; US
CHAI, Deping; US
Priority Data:
62/469,01409.03.2017US
Title (EN) METHOD OF CONSTRUCTING A REUSABLE LOW-DIMENSIONALITY MAP OF HIGH-DIMENSIONALITY DATA
(FR) PROCÉDÉ DE CONSTRUCTION D’UNE CARTE À FAIBLE DIMENSIONNALITÉ RÉUTILISABLE DE DONNÉES À HAUTE DIMENSIONNALITÉ
Abstract:
(EN) In one embodiment, there is a computer-implemented method of constructing a reusable low- dimensionality map. The method may comprise the steps performed at one or more computing devices. The one or more computing devices may create a plurality of high-dimensionality bins using a binning algorithm and using a subset of the measured variables representing each object. The one or more computing devices may calculate high-dimensionality bin centroid coordinates for each of the high-dimensionality bins. The one or more computing devices may embed the high- dimensionality bin centroid coordinates in a low dimensionality space using a dimensionality reduction algorithm. The one or more computing devices may produce a low dimensionality map representing the high-dimensionality space, the low-dimensionality map including a plurality of bin representations. The one or more computing devices may apply the mapping from the high- dimensionality space to the low-dimensionality space to a new data set comprised of one or more samples, previously withheld or unavailable, generated with a data collection method consistent with the data collection method from which the plurality of high-dimensional bins was generated.
(FR) Selon un mode de réalisation, l’invention concerne un procédé informatisé de construction d’une carte à faible dimensionnalité réutilisable. Le procédé peut consister en des étapes conduites dans un ou plusieurs dispositifs informatiques. Le ou les dispositifs informatiques peuvent créer une pluralité de compartiments à haute dimensionnalité au moyen d’un algorithme de compartimentage et au moyen d’un sous-ensemble des variables mesurées représentant chaque objet. Le ou les dispositifs informatiques peuvent calculer des coordonnées de centroïdes des compartiments à haute dimensionnalité pour chacun des compartiments à haute dimensionnalité. Le ou les dispositifs informatiques peuvent incorporer les coordonnées de centroïdes des compartiments à haute dimensionnalité dans un espace à faible dimensionnalité au moyen d’un algorithme de réduction de dimensionnalité. Le ou les dispositifs informatiques peuvent produire une carte à faible dimensionnalité représentant l’espace à haute dimensionnalité, la carte à faible dimensionnalité incluant une pluralité de représentations de compartiments. Le ou les dispositifs informatiques peuvent appliquer la cartographie de l’espace à haute dimensionnalité à l’espace à faible dimensionnalité à un nouvel ensemble de données constitué d’un ou plusieurs échantillons, précédemment retenus ou indisponibles, générés selon un procédé de collecte de données approprié au procédé de collecte grâce auquel la pluralité de compartiments à haute dimensionnalité a été générée.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)